A genome-wide screen reveals new regulators of the 2-cell-like cell state

生物 基因组 细胞生物学 遗传学 细胞 基因 计算生物学
作者
Nikhil Gupta,Lounis Yakhou,Julien Richard Albert,Anaelle Azogui,Laure Ferry,Olivier Kirsh,Fumihito Miura,Sarah Battault,Kosuke Yamaguchi,Marthe Laisné,Cécilia Domrane,Frédéric Bonhomme,Arpita Sarkar,Marine Delagrange,Bertrand Ducos,Gaël Cristofari,Takashi Ito,Max Greenberg,Pierre‐Antoine Defossez
出处
期刊:Nature Structural & Molecular Biology [Nature Portfolio]
卷期号:30 (8): 1105-1118 被引量:5
标识
DOI:10.1038/s41594-023-01038-z
摘要

In mammals, only the zygote and blastomeres of the early embryo are totipotent. This totipotency is mirrored in vitro by mouse ‘2-cell-like cells’ (2CLCs), which appear at low frequency in cultures of embryonic stem cells (ESCs). Because totipotency is not completely understood, we carried out a genome-wide CRISPR knockout screen in mouse ESCs, searching for mutants that reactivate the expression of Dazl, a gene expressed in 2CLCs. Here we report the identification of four mutants that reactivate Dazl and a broader 2-cell-like signature: the E3 ubiquitin ligase adaptor SPOP, the Zinc-Finger transcription factor ZBTB14, MCM3AP, a component of the RNA processing complex TREX-2, and the lysine demethylase KDM5C. All four factors function upstream of DPPA2 and DUX, but not via p53. In addition, SPOP binds DPPA2, and KDM5C interacts with ncPRC1.6 and inhibits 2CLC gene expression in a catalytic-independent manner. These results extend our knowledge of totipotency, a key phase of organismal life. Here, the authors identify four novel regulators of the 2-cell-like state, and thus totipotency, via unbiased CRISPR knockout screens and Dazl re-expression as a readout. They show that these factors act upstream of DPPA2 and DUX, and independently of p53.
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