Deciphering associations between dissolved organic molecules and bacterial communities in a pelagic marine system

浮游细菌 溶解有机碳 生物 远洋带 碳循环 微生物种群生物学 陆源沉积物 环境化学 有机质 海洋噬菌体 生态学 微生物生态学 横断面 玫瑰杆菌 浮游生物 营养物 生态系统 浮游植物 细菌 系统发育学 化学 基因 古生物学 生物化学 遗传学 克莱德 沉积岩
作者
Helena Osterholz,Gabriel Singer,Bernd Wemheuer,Rolf Daniel,Meinhard Simon,Jutta Niggemann,Thorsten Dittmar
出处
期刊:The ISME Journal [Springer Nature]
卷期号:10 (7): 1717-1730 被引量:149
标识
DOI:10.1038/ismej.2015.231
摘要

Dissolved organic matter (DOM) is the main substrate and energy source for heterotrophic bacterioplankton. To understand the interactions between DOM and the bacterial community (BC), it is important to identify the key factors on both sides in detail, chemically distinct moieties in DOM and the various bacterial taxa. Next-generation sequencing facilitates the classification of millions of reads of environmental DNA and RNA amplicons and ultrahigh-resolution mass spectrometry yields up to 10 000 DOM molecular formulae in a marine water sample. Linking this detailed biological and chemical information is a crucial first step toward a mechanistic understanding of the role of microorganisms in the marine carbon cycle. In this study, we interpreted the complex microbiological and molecular information via a novel combination of multivariate statistics. We were able to reveal distinct relationships between the key factors of organic matter cycling along a latitudinal transect across the North Sea. Total BC and DOM composition were mainly driven by mixing of distinct water masses and presumably retain their respective terrigenous imprint on similar timescales on their way through the North Sea. The active microbial community, however, was rather influenced by local events and correlated with specific DOM molecular formulae indicative of compounds that are easily degradable. These trends were most pronounced on the highest resolved level, that is, operationally defined 'species', reflecting the functional diversity of microorganisms at high taxonomic resolution.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
ccon发布了新的文献求助10
刚刚
1秒前
1秒前
hh完成签到,获得积分10
1秒前
1秒前
爱学习的小张完成签到,获得积分20
1秒前
1秒前
孟梦发布了新的文献求助10
2秒前
tingyan完成签到,获得积分10
2秒前
搜集达人应助科研通管家采纳,获得10
2秒前
研友_VZG7GZ应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
molihuakai应助科研通管家采纳,获得10
3秒前
3秒前
无极微光应助科研通管家采纳,获得20
3秒前
liu完成签到 ,获得积分10
3秒前
周鑫完成签到,获得积分10
3秒前
yangx发布了新的文献求助10
3秒前
娜嘉完成签到,获得积分10
4秒前
虫子完成签到,获得积分10
4秒前
Brad_AN完成签到,获得积分10
5秒前
7733发布了新的文献求助10
5秒前
小涂完成签到,获得积分10
5秒前
于思枫完成签到,获得积分10
5秒前
123完成签到,获得积分10
6秒前
洋气天天完成签到,获得积分10
6秒前
牛马完成签到,获得积分10
6秒前
跳跃的大碗完成签到,获得积分10
7秒前
笨蛋搞笑女完成签到 ,获得积分10
7秒前
minggalaxy007发布了新的文献求助10
7秒前
dyp完成签到,获得积分10
8秒前
李先森完成签到,获得积分10
8秒前
四大天王看电势完成签到,获得积分10
8秒前
鸿俦鹤侣完成签到 ,获得积分0
8秒前
tian发布了新的文献求助10
8秒前
默默的立辉完成签到,获得积分10
9秒前
君不见钱包渐扁完成签到,获得积分10
10秒前
William完成签到 ,获得积分10
10秒前
酷波er应助小梨采纳,获得30
10秒前
研友_VZG7GZ应助二强采纳,获得10
10秒前
rabbit完成签到,获得积分10
10秒前
高分求助中
Principles of Economics, 11th Edition 10000
Prescott's Microbiology: 2026 Release ISE 10000
University Physics with Modern Physics, 16th edition 10000
Cronologia da história de Macau 5000
Merrill's Atlas of Radiographic Positioning and Procedures - 3-Volume Set, 16th Edition 2000
Interactions of Vowel Quality and Prosody in East Slavic 1000
Erwählung und Berufung bei Paulus: Bedeutung, Entwicklung und Funktion einer Vorstellung in ihrem frühjüdischen und griechisch-römischen Kontext 850
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7146744
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8793463
关于积分的说明 18582783
捐赠科研通 6741411
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3158088
关于科研通互助平台的介绍 2288984
邀请新用户注册赠送积分活动 2132401