Process Development of a Macrocyclic Peptide Inhibitor of PD-L1

化学 不稳定性 肽合成 组合化学 水解 侧链 环肽 降水 有机化学 生物化学 物理 气象学 聚合物
作者
Subha Mukherjee,Amanda Rogers,Gardner S. Creech,Chao Hang,Antonio Ramı́rez,Michael Dummeldinger,Shawn B. Brueggemeier,Claudio Mapelli,Serge Zaretsky,Masano Huang,Regina Black,Michael Peddicord,Nicolas Cunière,James Kempson,Joseph Pawluczyk,Martin P. Allen,Rodney L. Parsons,Chris Sfouggatakis
出处
期刊:Journal of Organic Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:89 (10): 6651-6663 被引量:6
标识
DOI:10.1021/acs.joc.4c00430
摘要

This article outlines the process development leading to the manufacture of 800 g of BMS-986189, a macrocyclic peptide active pharmaceutical ingredient. Multiple N-methylated unnatural amino acids posed challenges to manufacturing due to the lability of the peptide to cleavage during global side chain deprotection and precipitation steps. These issues were exacerbated upon scale-up, resulting in severe yield loss and necessitating careful impurity identification, understanding the root cause of impurity formation, and process optimization to deliver a scalable synthesis. A systematic study of macrocyclization with its dependence on concentration and pH is presented. In addition, a side chain protected peptide synthesis is discussed where the macrocyclic protected peptide is extremely labile to hydrolysis. A computational study explains the root cause of the increased lability of macrocyclic peptide over linear peptide to hydrolysis. A process solution involving the use of labile protecting groups is discussed. Overall, the article highlights the advancements achieved to enable scalable synthesis of an unusually labile macrocyclic peptide by solid-phase peptide synthesis. The sustainability metric indicates the final preparative chromatography drives a significant fraction of a high process mass intensity (PMI).
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