A review of methods for predicting DNA N6-methyladenine sites

计算机科学 过程(计算) 鉴定(生物学) 人工智能 机器学习 序列(生物学) 数据挖掘 化学 生物 生物化学 植物 操作系统
作者
Koeun Han,Jianchun Wang,Yu Wang,Lei Zhang,Mengyao Yu,Fang Xie,Dequan Zheng,Yaoqun Xu,Yongsheng Ding,Jie Wan
出处
期刊:Briefings in Bioinformatics [Oxford University Press]
卷期号:24 (1)
标识
DOI:10.1093/bib/bbac514
摘要

Deoxyribonucleic acid(DNA) N6-methyladenine plays a vital role in various biological processes, and the accurate identification of its site can provide a more comprehensive understanding of its biological effects. There are several methods for 6mA site prediction. With the continuous development of technology, traditional techniques with the high costs and low efficiencies are gradually being replaced by computer methods. Computer methods that are widely used can be divided into two categories: traditional machine learning and deep learning methods. We first list some existing experimental methods for predicting the 6mA site, then analyze the general process from sequence input to results in computer methods and review existing model architectures. Finally, the results were summarized and compared to facilitate subsequent researchers in choosing the most suitable method for their work.
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