Deep learning approaches for de novo drug design: An overview

计算机科学 深度学习 强化学习 生成语法 人工智能 药品 代表(政治) 自编码 药物靶点 机器学习 计算生物学 生物 药理学 政治学 政治 法学
作者
Mingyang Wang,Zhe Wang,Huiyong Sun,Jike Wang,Chao Shen,Gaoqi Weng,Xin Chai,Honglin Li,Dongsheng Cao,Tingjun Hou
出处
期刊:Current Opinion in Structural Biology [Elsevier]
卷期号:72: 135-144 被引量:137
标识
DOI:10.1016/j.sbi.2021.10.001
摘要

De novo drug design is the process of generating novel lead compounds with desirable pharmacological and physiochemical properties. The application of deep learning (DL) in de novo drug design has become a hot topic, and many DL-based approaches have been developed for molecular generation tasks. Generally, these approaches were developed as per four frameworks: recurrent neural networks; encoder-decoder; reinforcement learning; and generative adversarial networks. In this review, we first introduced the molecular representation and assessment metrics used in DL-based de novo drug design. Then, we summarized the features of each architecture. Finally, the potential challenges and future directions of DL-based molecular generation were prospected.
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