Noncompetitive Determination of Small Analytes by Sandwich-Type Lateral Flow Assay Based on an Aptamer Kissing Complex

适体 化学 分析物 检出限 小分子 核糖核酸 信号(编程语言) 线性范围 核酸 生物物理学 组合化学 色谱法 生物化学 分子生物学 生物 基因 计算机科学 程序设计语言
作者
Benoît Chovelon,Ranganathan Velu,Sathya Srinivasan,Erin M. McConnell,Patrice Faure,Emmanuelle Fiore,Corinne Ravelet,Eric Peyrin,Maria C. DeRosa
出处
期刊:Analytical Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:96 (18): 6875-6880
标识
DOI:10.1021/acs.analchem.3c05472
摘要

Here, we present the proof-of-concept of a lateral flow assay (LFA) that is capable of detecting small-molecule targets in a noncompetitive manner by deploying a sandwich-type format based on the aptamer kissing complex (AKC) strategy. A fluorescently labeled hairpin aptamer served as the signaling agent, while a specific RNA hairpin grafted onto the strip served as the capture element. The hairpin aptamer switched from an unfolded to a folded form in the presence of the target, resulting in kissing interactions between the loops of the reporter and the capture agents. This design triggered a target-dependent fluorescent signal at the test line. The AKC-based LFA was developed for the detection of adenosine, achieving a detection limit in the micromolar range. The assay revealed the presence of the same analyte in urine. The method also proved effective with another small molecule (theophylline). We believe that the AKC-based LFA approach could overcome many of the shortcomings associated with conventional signal-off methods and competitive processes.

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