Structural insights into the AFB1 aptamer coupled with a rationally designed CRISPR/Cas12a-Exo III aptasensor for AFB1 detection

适体 范德瓦尔斯力 化学 分子识别 清脆的 纳米技术 合理设计 分子 材料科学 生物 分子生物学 生物化学 基因 有机化学
作者
Pengfei Ma,Hualin Guo,Hua Ye,Yin Zhang,Zhouping Wang
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier BV]
卷期号:225: 1164-1171 被引量:30
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.11.177
摘要

Aflatoxin B1 (AFB1) is a typical food contaminant. A truncated DNA aptamer of AFB1 was reported by our team in previous work. However, the recognition mechanism between aptamer and AFB1 was lacking, which was crucial for the design of related aptasensor. Herein, the binding of aptamer to AFB1 was systematically studied and found that it was an exothermic process and the conformation of aptamer changed during the recognition process. Loop bases in the secondary structure of aptamer formed a special binding pocket to recognize AFB1. Van der Waals and electrostatic interaction were the main driving forces. By blocking the stem bases guided by the structural investigation, a rationally designed CRISPR/Cas12a-Exo III aptasensor for AFB1 detection was constructed, and the sensitivity was improved by target recycling. Under optimal conditions, the linear detection range for AFB1 was 0.01-20 ng/mL, and AFB1 was accurately determined in corn and wheat samples. This work laid a theoretical foundation for the design of AFB1 aptasensor, and the developed detection model came up with new ideas for the development of CRISPR/Cas12a-based aptasensor.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Enoch发布了新的文献求助10
2秒前
3秒前
4秒前
1111111111111发布了新的文献求助10
4秒前
4秒前
科研通AI2S应助王冉冉采纳,获得10
4秒前
Xiaohu完成签到,获得积分10
5秒前
dtf完成签到,获得积分10
5秒前
凡迪亚比完成签到,获得积分10
5秒前
5秒前
香蕉觅云应助小朱佩奇采纳,获得10
6秒前
无语的代真完成签到,获得积分10
6秒前
7秒前
包凡之完成签到,获得积分10
8秒前
情怀应助自由橘子采纳,获得10
8秒前
zzz发布了新的文献求助10
8秒前
CipherSage应助1111111111111采纳,获得10
9秒前
搞怪南风完成签到,获得积分10
9秒前
文章使我快了完成签到,获得积分10
9秒前
cooper完成签到 ,获得积分10
10秒前
Ou发布了新的文献求助10
10秒前
sxx完成签到,获得积分10
10秒前
上官若男应助tanglu采纳,获得10
10秒前
麋鹿完成签到 ,获得积分10
10秒前
公西翠萱完成签到 ,获得积分10
10秒前
qixiaoqi发布了新的文献求助10
11秒前
博慧完成签到 ,获得积分10
12秒前
小刘医生完成签到,获得积分10
14秒前
安安完成签到,获得积分10
14秒前
啊啊啊啊完成签到,获得积分10
14秒前
英俊的铭应助飞飞鱼采纳,获得10
16秒前
科目三应助zzz采纳,获得10
16秒前
小小西瓜萝卜青菜完成签到,获得积分10
16秒前
思源应助虚幻采枫采纳,获得10
17秒前
17秒前
不安的可乐完成签到,获得积分10
17秒前
18秒前
nano完成签到 ,获得积分10
18秒前
da完成签到,获得积分10
18秒前
科研通AI2S应助啊啊啊啊采纳,获得10
19秒前
高分求助中
【提示信息,请勿应助】关于scihub 10000
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] 3000
徐淮辽南地区新元古代叠层石及生物地层 3000
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
Handbook of Industrial Diamonds第二卷 1200
Global Eyelash Assessment scale (GEA) 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 550
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4038657
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3576306
关于积分的说明 11375198
捐赠科研通 3306108
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1819379
邀请新用户注册赠送积分活动 892698
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 815066