TRIM58 is a prognostic biomarker remodeling the tumor microenvironment in KRAS-driven lung adenocarcinoma

克拉斯 腺癌 肿瘤微环境 间质细胞 癌症研究 肺癌 肿瘤科 内科学 医学 生物标志物 生物 癌症 结直肠癌 肿瘤细胞 生物化学
作者
Xiaowei Chen,Yu Wang,Xiao Qu,Fenglong Bie,Yadong Wang,Jiajun Du
出处
期刊:Future Oncology [Future Medicine]
卷期号:17 (5): 565-579 被引量:9
标识
DOI:10.2217/fon-2020-0645
摘要

Aim: To comprehensively analyze the expression profiles of ubiquitin-related genes (URGs) and determine potential biomarkers in KRAS-driven lung adenocarcinoma (LUAD). Materials & methods: Differential expression analyses were performed between KRAS-wild and KRAS-mutant LUAD samples from The Cancer Genome Atlas database, and 34 URGs were screened out. ESTIMATE and CIBERSORT methods were used to calculate the ratio of immune and stromal components. Results & conclusion: TRIM58 was positively correlated with abundances of M2 macrophages and resting mast cells and negatively correlated with follicular helper T-cell abundances in KRAS-driven LUAD. TRIM58 was a potential prognosis-associated indicator for tumor microenvironment modulation and played a key role in TME-specific AS landscapes alterations in KRAS-driven LUAD.
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