Development of a novel 7 immune-related genes prognostic model for oral cancer: A study based on TCGA database

基因 免疫疗法 生物标志物 医学 生物 肿瘤科 癌症研究 免疫系统 免疫学 遗传学
作者
Xiaotong Zhao,Yan Zhu,Jiefu Zhou,Yujing Gao,Fangzhou Liu
出处
期刊:Oral Oncology [Elsevier]
卷期号:112: 105088-105088 被引量:25
标识
DOI:10.1016/j.oraloncology.2020.105088
摘要

Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is an aggressive tumor whose prognosis has little improvement in the last three decades. Various immune-related genes have been suggested as significant roles in the development and progression of malignant cancers. In this study, we acquired and integrated differentially expressed genes of OSCC patients, including immune-related genes and transcription factors (TFs), from The Cancer Genome Atlas (TCGA) database. TF-mediated network was established to exploring the regulatory mechanisms of prognostic immune-related genes. A 7 immune-related genes prognostic model for OSCC was obtained, including CGB8, CTLA4, TNFRSF19, CCL26, NRG1, TPM2 and PLAU, which was further proved to be an independent prognostic indicator after adjusting for other clinical factors. The immune-related genes prognostic index was significantly negatively correlated to the infiltration abundances of B cells (P < 0.05) and CD8+ T cells (P < 0.05). The novel proposed immune-based prognostic model not only provided a promising biomarker and a way to monitor the long-term treatment of OSCC, but also gave a new insight into a potential immunotherapy strategy.
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