DNA protein binding recognition based on lifelong learning

人工智能 计算机科学 水准点(测量) 机器学习 领域(数学) 模式识别(心理学) 样品(材料) 灵敏度(控制系统) 深度学习 鉴定(生物学) 数据挖掘 数学 化学 植物 大地测量学 色谱法 电子工程 纯数学 工程类 生物 地理
作者
Yongsan Liu,Shixuan Guan,Tengsheng Jiang,Qiming Fu,Jieming Ma,Zhiming Cui,Yijie Ding,Hongjie Wu
出处
期刊:Computers in Biology and Medicine [Elsevier BV]
卷期号:164: 107094-107094 被引量:4
标识
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107094
摘要

In recent years, research in the field of bioinformatics has focused on predicting the raw sequences of proteins, and some scholars consider DNA-binding protein prediction as a classification task. Many statistical and machine learning-based methods have been widely used in DNA-binding proteins research. The aforementioned methods are indeed more efficient than those based on manual classification, but there is still room for improvement in terms of prediction accuracy and speed. In this study, researchers used Average Blocks, Discrete Cosine Transform, Discrete Wavelet Transform, Global encoding, Normalized Moreau-Broto Autocorrelation and Pseudo position-specific scoring matrix to extract evolutionary features. A dynamic deep network based on lifelong learning architecture was then proposed in order to fuse six features and thus allow for more efficient classification of DNA-binding proteins. The multi-feature fusion allows for a more accurate description of the desired protein information than single features. This model offers a fresh perspective on the dichotomous classification problem in bioinformatics and broadens the application field of lifelong learning. The researchers ran trials on three datasets and contrasted them with other classification techniques to show the model's effectiveness in this study. The findings demonstrated that the model used in this research was superior to other approaches in terms of single-sample specificity (81.0%, 83.0%) and single-sample sensitivity (82.4%, 90.7%), and achieves high accuracy on the benchmark dataset (88.4%, 80.0%, and 76.6%).

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Luka完成签到,获得积分10
刚刚
长安完成签到 ,获得积分10
刚刚
蔡姬发布了新的文献求助10
刚刚
向阳而生完成签到,获得积分10
1秒前
黑羊发布了新的文献求助20
2秒前
科研通AI6.1应助ct采纳,获得10
2秒前
傻子也能搞学术吗完成签到 ,获得积分10
2秒前
拾英完成签到,获得积分10
3秒前
哦哦哦完成签到 ,获得积分10
3秒前
3秒前
完美世界应助小多快跑采纳,获得10
3秒前
dinmei发布了新的文献求助10
4秒前
hjh发布了新的文献求助10
5秒前
5秒前
迷人念柏完成签到,获得积分10
6秒前
6秒前
7秒前
Starwalker应助syy采纳,获得10
7秒前
科研通AI6.4应助樊珩采纳,获得10
8秒前
现代的绿真完成签到,获得积分10
8秒前
Function发布了新的文献求助10
8秒前
动听的念文完成签到 ,获得积分10
9秒前
10秒前
汉堡包应助胡勇超采纳,获得10
10秒前
呜呜完成签到,获得积分10
10秒前
10秒前
11秒前
李漾漾完成签到,获得积分10
11秒前
2222完成签到,获得积分10
11秒前
JunMa发布了新的文献求助10
12秒前
HOH发布了新的文献求助10
12秒前
ZEB发布了新的文献求助10
12秒前
海上森林的一只猫完成签到 ,获得积分10
13秒前
14秒前
冬谎完成签到,获得积分10
14秒前
浮云客发布了新的文献求助10
14秒前
14秒前
852应助sasa采纳,获得10
14秒前
14秒前
阿赖发布了新的文献求助10
16秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Cronologia da história de Macau 5000
Petrology and Plate Tectonics 800
Electrode Potentials 550
Matrix Methods in Data Mining and Pattern Recognition 510
Association of Reentry Well-Being with Psychological Distress, Employment, and Housing Instability 15-Months After Incarceration 500
Trees of tropical Asia : an illustrated guide to diversity 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7030556
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8700256
关于积分的说明 18433194
捐赠科研通 6532319
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3112613
关于科研通互助平台的介绍 2191121
邀请新用户注册赠送积分活动 2088091