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Structural and functional characterization of SidF, a possible dual substrateAspergillus fumigatusN5-acetyl-N5-hydroxy-L-ornithine transacetylase

烟曲霉 化学 基质(水族馆) 生物化学 表征(材料科学) 微生物学 鸟氨酸 生物 材料科学 纳米技术 氨基酸 精氨酸 生态学
作者
Thanalai Poonsiri,Nicola Demitri,Jan Stránský,Hubertus Haas,Michele Cianci,Stefano Benini
标识
DOI:10.1101/2024.08.03.606473
摘要

Abstract Siderophore-mediated iron acquisition is essential for the virulence of Aspergillus fumigatus , a fungus causing life-threatening aspergillosis. Developing drugs targeting the siderophore biosynthetic pathway could help improve disease management. The transacetylases SidF and SidL generate intermediates for different siderophores in A. fumigatus . A. fumigatus has a yet unidentified transacetylase that complements SidL during iron deficiency in SidL-lacking mutants. We present the first X-ray structure of SidF, revealing a conserved two-domain architecture with tetrameric assembly. Importantly, the N-terminal domain contributes to protein solubility and oligomerization, while the C-terminal domain containing the GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT) motif is crucial for the enzymatic activity and mediates oligomer formation. Notably, AlphaFold modelling demonstrated structural similarity between SidF and SidL. Enzymatic assays showed that SidF can utilize acetyl-CoA as a donor, previously thought to be a substrate of SidL but not SidF, and selectively uses N5-hydroxy-L-ornithine as an acceptor. Based on these findings, we propose SidF as the unknown transacetylase complementing SidL activity, highlighting its central role in A. fumigatus siderophore biosynthesis. This study elucidates the structure of SidF and reveals a novel role in siderophore biosynthesis. Investigation of this uncharacterized GNAT protein enhances our understanding of fungal virulence and holds promise for its potential application in developing antifungal therapies.
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