Automatic subtyping of Diffuse Large B-cell Lymphomas (DLBCL): Raman-based genetic and metabolic classification

亚型 淋巴瘤 弥漫性大B细胞淋巴瘤 生发中心 计算生物学 癌症研究 化学 生物 医学 病理 B细胞 遗传学 抗体 计算机科学 程序设计语言
作者
Patrycja Dawiec,Patrycja Leszczenko,Anna Maria Nowakowska,Paulina Laskowska,Maciej Szydłowski,Przemysław Juszczyński,Małgorzata Barańska,Piotr Mrówka,Katarzyna Majzner
出处
期刊:Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy [Elsevier]
卷期号:309: 123795-123795 被引量:2
标识
DOI:10.1016/j.saa.2023.123795
摘要

Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), the most common non-Hodgkin's lymphoma in adults, is a genetically and metabolically heterogeneous group of aggressive malignancies. The complexity of their molecular composition and the variability in clinical presentation make clinical diagnosis and treatment selection a serious challenge. The challenge is therefore to quickly and correctly classify DLBCL cells. In this work, we show that Raman imaging is a tool with high diagnostic potential, providing unique information about the biochemical components of tumor cells and their metabolism. We present models of classification of lymphoma cells based on their Raman spectra. The models automatically and efficiently identify DLBCL cells and assign them to a given cell-of-origin (COO) subtype (activated B cell-like (ABC) or germinal center B cell-like (GCB)) or, respectively, to a comprehensive cluster classification (CCC) subtype (OxPhos/non-OxPhos). In addition, we describe each lymphoma subtype by its unique spectral profile, linking it to biochemical, genetic, or metabolic features.

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