A Split CRISPR–Cpf1 Platform for Inducible Gene Activation

清脆的 基因组编辑 光遗传学 Cas9 基因 计算生物学 生物 激活剂(遗传学) 核糖核酸 内生 核酸内切酶 引导RNA 基因组 遗传学 神经科学 生物化学
作者
Takahiro Otabe,Yuta Nihongaki,Moritoshi Sato
出处
期刊:Methods in molecular biology 卷期号:: 229-240 被引量:1
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-2724-2_16
摘要

The CRISPR–Cpf1 also known as Cas12a is an RNA-guided endonuclease similar to CRISPR–Cas9. Combining the CRISPR–Cpf1 with optogenetics technology, we have engineered photoactivatable Cpf1 (paCpf1) to precisely control the genome sequence in a spatiotemporal manner. We also identified spontaneously activated split Cpf1 and thereby developed a potent dCpf1 split activator, which has the potential to activate endogenous target genes. Here we describe a method for optogenetic endogenous genome editing using paCpf1 in mammalian cells. Furthermore, we show a method for endogenous gene activation using dCpf1 split activator in mammalian cells and mice.
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