The latest automated docking technologies for novel drug discovery

对接(动物) 蛋白质-配体对接 计算机科学 药物发现 计算生物学 虚拟筛选 生化工程 纳米技术 生物信息学 工程类 生物 材料科学 医学 护理部
作者
Julio Caballero
出处
期刊:Expert Opinion on Drug Discovery [Informa]
卷期号:16 (6): 625-645 被引量:32
标识
DOI:10.1080/17460441.2021.1858793
摘要

Molecular docking has been consolidated as one of the most important methods in the molecular modeling field. It has been recognized as a prominent tool in the study of protein-ligand complexes, to describe intermolecular interactions, to accurately predict poses of multiple ligands, to discover novel promising bioactive compounds. Molecular docking methods have evolved in terms of their accuracy and reliability; but there are pending issues to solve for improving the connection between the docking results and the experimental evidence.In this article, the author reviews very recent innovative molecular docking applications with special emphasis on reverse docking, treatment of protein flexibility, the use of experimental data to guide the selection of docking poses, the application of Quantum mechanics(QM) in docking, and covalent docking.There are several issues being worked on in recent years that will lead to important breakthroughs in molecular docking methods in the near future These developments are related to more efficient exploration of large datasets and receptor conformations, advances in electronic description, and the use of structural information for guiding the selection of results.

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