Expansion and loss events characterized the occurrence of MIF-like genes in bivalves

生物 新功能化 巨噬细胞移动抑制因子 贻贝科 基因 同步 脊椎动物 谱系(遗传) 遗传学 基因家族 进化生物学 基因组 转录组 系统发育学 基因表达 动物 软体动物 细胞因子 双壳类
作者
Umberto Rosani,Stefania Domeneghetti,Marco Gerdol,Alberto Pallavicini,Paola Venier
出处
期刊:Fish & Shellfish Immunology [Elsevier BV]
卷期号:93: 39-49 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.fsi.2019.07.019
摘要

Macrophage migration inhibitory factor (MIF) dynamically connects innate and adaptive immune systems in vertebrate animals, allowing highly orchestrated systemic responses to various insults. The occurrence of MIF-like genes in non-vertebrate organisms suggests its origin from an ancestral metazoan gene, whose function is still a matter of debate. In the present work, by analyzing available genomic and transcriptomic data from bivalve mollusks, we identified 137 MIF-like sequences, which were classified into three types, based on phylogeny and conservation of key residues: MIF, D-DT, and the lineage-specific type MDL. Comparative genomics revealed syntenic conservation of homologous genes at the family level, the loss of D-DT in the Ostreidae family as well as the expansion of MIF-like genes in the Mytilidae family, possibly underpinning the neofunctionalization of duplicated gene copies. In M. galloprovincialis, MIF and one D-DT were mostly expressed in haemocytes and mantle rim of untreated animals, while D-DT paralogs often showed very limited expression, suggesting an accessory role or their persistence as relict genes.
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