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CDetection: CRISPR-Cas12b-based DNA detection with sub-attomolar sensitivity and single-base specificity

生物 清脆的 计算生物学 核酸 基因分型 DNA 灵敏度(控制系统) 遗传学 碱基对 基因 基因型 工程类 电子工程
作者
Fei Teng,Lu Guo,Tongtong Cui,Xin-Ge Wang,Kai Xu,Qingqin Gao,Qi Zhou,Wei Li
出处
期刊:Genome Biology [Springer Nature]
卷期号:20 (1) 被引量:269
标识
DOI:10.1186/s13059-019-1742-z
摘要

CRISPR-based nucleic acid detection methods are reported to facilitate rapid and sensitive DNA detection. However, precise DNA detection at the single-base resolution and its wide applications including high-fidelity SNP genotyping remain to be explored. Here we develop a Cas12b-mediated DNA detection (CDetection) strategy, which shows higher sensitivity on examined targets compared with the previously reported Cas12a-based detection platform. Moreover, we show that CDetection can distinguish differences at the single-base level upon combining the optimized tuned guide RNA (tgRNA). Therefore, our findings highlight the high sensitivity and accuracy of CDetection, which provides an efficient and highly practical platform for DNA detection.
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