Pharmacogenomic agreement between two cancer cell line data sets

药物基因组学 癌细胞系 癌症 一致性 基因组学 药物反应 计算生物学 抗癌药物 药品 生物 生物信息学 医学 癌细胞 遗传学 药理学 基因组 基因 物理 量子力学
作者
Nicolas Stransky,Mahmoud Ghandi,Gregory V. Kryukov,Levi A. Garraway,Arnaud Amzallag,Iulian Pruteanu-Malinici,Daniel A. Haber,Sridhar Ramaswamy,Cyril H. Benes,Joseph Lehar,Manway Liu,Dmitriy Sonkin,Audrey Kauffmann,Kavitha Venkatesan,Elena J. Edelman,Markus Riester,Jordi Barretina,Giordano Caponigro,Robert A. Schlegel,William R. Sellers,Frank Stegmeier,Michael T. Morrissey,Michael P. Menden,Francesco Iorio,Michael R. Stratton,Michael W. McDermott,Julio Saez-Rodriguez,Mathew J. Garnett
出处
期刊:Nature [Springer Nature]
卷期号:528 (7580): 84-87 被引量:340
标识
DOI:10.1038/nature15736
摘要

Large cancer cell line collections broadly capture the genomic diversity of human cancers and provide valuable insight into anti-cancer drug response. Here we show substantial agreement and biological consilience between drug sensitivity measurements and their associated genomic predictors from two publicly available large-scale pharmacogenomics resources: The Cancer Cell Line Encyclopedia and the Genomics of Drug Sensitivity in Cancer databases.
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