Dynamic analysis of peripheral blood TCR β-chain CDR3 repertoire in occupational medicamentosa-like dermatitis due to trichloroethylene

T细胞受体 互补决定区 免疫学 基因 外周血 T细胞 剧目 生物 遗传学 肽序列 免疫系统 声学 物理
作者
Dafeng Lin,Dianpeng Wang,Peimao Li,Xiangli Yang,Wei Liu,Lu Huang,Zhimin Zhang,Yanfang Zhang,Zhang Wen,Naixing Zhang,Ming Zhang,Xianqing Huang
出处
期刊:Scientific Reports [Springer Nature]
卷期号:11 (1) 被引量:2
标识
DOI:10.1038/s41598-021-89431-w
摘要

Abstract Previously, we had cross-sectionally explored the characteristics of T cell receptor (TCR) repertoires from occupational medicamentosa-like dermatitis due to trichloroethylene (OMDT) patients, now we further analyzed the dynamic features of OMDT TCR repertoires. Peripheral blood TCR β-chain complementarity-determining region 3 (CDR3) genes were detected with the high throughput sequencing in 24 OMDT cases in their acute, chronic and recovery stages, respectively, and in 24 trichloroethylene-exposed healthy controls. The TCR repertoire diversity, TRBV/TRBD/TRBJ gene usage and combination, frequencies of CDR3 nucleotide (nt) and amino acid (aa) sequences in the cases in different stages and in the controls were analyzed. TRBV6-4 and TRBV7-9 frequencies significantly differed between the cases and controls (both P < 6.1 × 10 –4 ). TRBV6-4 combination with TRBJ2-1, TRBJ2-2, TRBJ2-3, and TRBJ2-6, and TRBV7-9 combination with TRBJ2-1 were associated with the stage by OMDT severity (all P < 0.001). Ten CDR3-nt and 7 CDR3-aa sequences in TRBV7-9-TRBJ2-1 combination and 1 CDR3-nt and 1 CDR3-aa sequences in TRBV6-4-TRBJ2-1 combination were identified as associated with the severity of OMDT (all P < 0.001). We revealed further how TCR repertoires vary with the severity in the development of OMDT, and severity-related TCRs may provide important therapeutic targets for OMDT in clinical practice.
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