Genome-based reclassification of Salipiger manganoxidans (Rajasabapathy et al. 2016) Wirth et al. 2018 as a later heterotypic synonym of Salipiger marinus (Lai et al. 2011) Wirth et al. 2018

生物 系统发育树 同义词(分类学) 16S核糖体RNA 克莱德 基因组 系统发育学 焦测序 百万- 基因 动物 核糖体RNA 进化生物学 遗传学 物理 天文
作者
Yuxue Yang,Keqing Ni,Di Wang,Xinlei Wu,Yuli Wei
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:74 (4)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.006329
摘要

Salipiger manganoxidans VSW210 T was compared with Salipiger marinus CK-I3-6 T to examine the taxonomic relationship between the two type strains. In phylogenetic trees drawn using whole genome sequences and 16S rRNA gene sequences, S. manganoxidans VSW210 T and S. marinus CK-I3-6 T clade together and showed a 99.6 % 16S rRNA sequence similarity. The average amino acid identity (AAI), average nucleotide identity (ANIb and ANIm) and digital DNA–DNA hybridization (dDDH) values between S. manganoxidans VSW210 T and S. marinus CK-I3-6 T were below 97.5, 97.4, 98.4 and 85.1±2.5 %, respectively, all of which were greater than the species delineation threshold AAI value (95.5 %), ANI value (95–96 %) and dDDH value (70 %). Most phenotypic features between both species were almost identical, although there were some differences. The present results show that Salipiger manganoxidans is a later heterotypic synonym of Salipiger marinus .
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