Exploring the Mechanism of Activation of CFTR by Curcuminoids: An Ensemble Docking Study

囊性纤维化跨膜传导调节器 对接(动物) 姜黄素 环核苷酸结合域 化学 结合位点 生物物理学 突变体 生物化学 核苷酸 立体化学 细胞生物学 生物 医学 护理部 基因
作者
Emanuele Bellacchio
出处
期刊:International Journal of Molecular Sciences [MDPI AG]
卷期号:25 (1): 552-552
标识
DOI:10.3390/ijms25010552
摘要

Curcumin, a major constituent of turmeric (Curcuma longa L.), has beneficial effects against several diseases. In cystic fibrosis (CF), this compound improves patients’ symptoms by recovering the activity of a number of mutants of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR). Despite holding promise in the treatment of CF, the curcumin binding site in CFTR and the molecular mechanism of activation of this channel are still unknown. The results of this study, based on docking and molecular dynamics (MD) simulations, allow us to propose that curcumin binds the closed ATP-free CFTR near the nucleotide-binding domain 1 (NBD1)/ICl1/ICl4 interface. The bound ligand, once approached by the nucleotide-binding domain 2 (NBD2) during transient channel opening, lays at a multiple interdomain cross point. Thereafter, curcumin can bridge NBD1 and NBD2, and also ICL1/ICL4 and ICL2/ICL3, finally tightening the same interdomain interactions that normally uphold the open conformation in the wild-type ATP-bound CFTR. The proposed binding site is compatible with biochemical observations made in previous CFTR–curcumin interaction studies. These findings provide a framework for the design of novel drugs that activate CFTR mutants characterized by defects in ATP binding and/or NBD dimerization or even lacking NBD2.
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