Improved protocol for Bst polymerase and reverse transcriptase production and application to a point-of-care diagnostics system

逆转录酶 逆转录聚合酶链式反应 人口 聚合酶链反应 聚合酶 生物 病毒学 信使核糖核酸 医学 基因 生物化学 环境卫生
作者
Lucas R. de Souza,Ítalo Esposti Poly da Silva,Gabriele Celis-Silva,Bruna Winkert Raddatz,Louise Matiê Imamura,Edson Yu Sin Kim,Gabriel Vieira Valderrama,Halanna de Paula Riedi,Sérgio Renato Rogal,Bernardo Montesanti Machado de Almeida,Marcus Vinícius Mazega Figueredo,Mário Henrique Bengtson,Katlin B. Massirer
出处
期刊:Experimental Biology and Medicine [SAGE]
卷期号:248 (19): 1671-1683 被引量:1
标识
DOI:10.1177/15353702231215815
摘要

The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has raised awareness in the scientific community about the importance of being prepared for sanitary emergencies. Many measures implemented during the COVID pandemic are now being expanded to other applications. In the field of molecular and immunological diagnostics, the need to massively test the population worldwide resulted in the application of a variety of methods to detect viral infection. Besides gold standard reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR), the use of reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) arose as an alternative and sensitive method to amplify and detect viral genetic material. We have used openly available protocols and have improved the protein production of RT-LAMP enzymes Bst polymerase and HIV-reverse transcriptase. To optimize enzyme production, we tested different protein tags, and we shortened the protein purification protocol, resulting in reduced processing time and handling of the enzymes and, thus, preserved the protein activity with high purity. The enzymes showed significant stability at 4 °C and 25 °C, over 60 days, and were highly reliable when used as a one-step RT-LAMP reaction in a portable point-of-care device with clinical samples. The enzymes and the reaction setup can be further expanded to detect other infectious diseases agents.
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