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Single-cell genome-wide bisulfite sequencing for assessing epigenetic heterogeneity

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作者
Sébastien A. Smallwood,Heather Lee,Christof Angermueller,Felix Krueger,Heba Saadeh,Julian R. Peat,Simon Andrews,Oliver Stegle,Wolf Reik,Gavin Kelsey
出处
期刊:Nature Methods [Springer Nature]
卷期号:11 (8): 817-820 被引量:988
标识
DOI:10.1038/nmeth.3035
摘要

Single-cell bisulfite sequencing (scBS-seq) allows robust DNA methylation analysis in rare cells and heterogeneous populations. We report a single-cell bisulfite sequencing (scBS-seq) method that can be used to accurately measure DNA methylation at up to 48.4% of CpG sites. Embryonic stem cells grown in serum or in 2i medium displayed epigenetic heterogeneity, with '2i-like' cells present in serum culture. Integration of 12 individual mouse oocyte datasets largely recapitulated the whole DNA methylome, which makes scBS-seq a versatile tool to explore DNA methylation in rare cells and heterogeneous populations.
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