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Use of RNA‐seq to determine variation in canine cytochrome P450 mRNA expression between blood, liver, lung, kidney and duodenum in healthy beagles

信使核糖核酸 细胞色素P450 十二指肠 分子生物学 核糖核酸 生物 内科学 内分泌学 医学 基因 生物化学 新陈代谢
作者
Marike Visser,K. L. Weber,Gonzalo Rincón,Dawn A. Merritt
出处
期刊:Journal of Veterinary Pharmacology and Therapeutics [Wiley]
卷期号:40 (6): 583-590 被引量:8
标识
DOI:10.1111/jvp.12400
摘要

RNA sequencing ( RNA ‐seq) is a powerful tool for the evaluation and quantification of transcriptomes and expression patterns in animals, tissues, or pathological conditions. The purpose of this study was to determine the physiologic expression of cytochrome P450 ( CYP ) mRNA transcripts in whole blood, kidney, duodenum, liver, and lung in healthy, adult male ( n = 4) and female ( n = 4) beagles via RNA ‐seq. mRNA expression was above background (transcripts per million) for 45 canine CYP s, with liver, duodenum, and lung expressing a high number of xenobiotic metabolizing CYP s, while prominent endogenous metabolizing CYP expression was present in blood and kidney. The relative expression pattern of CYP 2A13 , 2B11 , 2C21 , 2D15 , 2E1 , 3A12, and 27A1 in liver, lung, and duodenum was verified through qPCR . This is the first global profiling of physiologic CYP mRNA expression in multiple canine tissues, providing a platform for further studies characterizing canine CYP s and changes in gene expression in disease states.

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