Photoinduced Dynamics with Constrained Vibrational Motion: FrozeNM Algorithm

激发态 正常模式 自由度(物理和化学) 联轴节(管道) 维数之咒 分子振动 放松(心理学) 振动 分子动力学 过程(计算) 统计物理学 计算机科学 从头算 运动(物理) 模式(计算机接口) 物理 生物系统 分子物理学 化学 材料科学 分子 计算化学 原子物理学 人工智能 量子力学 心理学 冶金 社会心理学 生物 操作系统
作者
Hassiel Negrín-Yuvero,Victor M. Freixas,Beatriz Rodríguez-Hernández,G. Rojas-Lorenzo,Sergei Tretiak,Adolfo Bastida,Sebastian Fernández-Alberti
出处
期刊:Journal of Chemical Theory and Computation [American Chemical Society]
卷期号:16 (12): 7289-7298 被引量:7
标识
DOI:10.1021/acs.jctc.0c00930
摘要

Ab initio molecular dynamics (AIMD) simulation, analyzed in terms of vibrational normal modes, is a widely used technique that facilitates understanding of complex structural motions and coupling between electronic and nuclear degrees of freedom. Usually, only a subset of vibrations is directly involved in the process of interest. The impact of these vibrations can be evaluated by performing AIMD simulations by selectively freezing certain motions. Herein, we present frozen normal mode (FrozeNM), a new algorithm to apply normal-mode constraints in AIMD simulations, as implemented in the nonadiabatic excited state molecular dynamics code. We further illustrate its capacity by analyzing the impact of normal-mode constraints on the photoinduced energy transfer between polyphenylene ethynylene dendrimer building blocks. Our results show that the electronic relaxation can be significantly slowed down by freezing a well-selected small subset of active normal modes characterized by their contributions in the direction of energy transfer. The application of these constraints reduces the nonadiabatic coupling between electronic excited states during the entire dynamical simulations. Furthermore, we validate reduced dimensionality models by freezing all the vibrations, except a few active modes. Altogether, we consider FrozeNM as a useful tool that can be broadly used to underpin the role of vibrational motion in a studied process and to formulate reduced models that describe essential physical phenomena.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
sga关注了科研通微信公众号
刚刚
dby完成签到,获得积分10
1秒前
1秒前
1秒前
2秒前
2秒前
3秒前
vv发布了新的文献求助10
3秒前
七个丸子完成签到,获得积分10
4秒前
搜集达人应助ardejiang采纳,获得10
5秒前
5秒前
随缘发布了新的文献求助10
5秒前
上官若男应助系小小鱼啊采纳,获得10
6秒前
finger发布了新的文献求助10
6秒前
6秒前
7秒前
7秒前
7秒前
思源应助brick2024采纳,获得10
7秒前
8秒前
8秒前
8秒前
锂炸完成签到,获得积分10
9秒前
9秒前
123321完成签到,获得积分10
9秒前
10秒前
Lucas应助Triptolide采纳,获得10
10秒前
cloud发布了新的文献求助10
10秒前
思源应助王粒采纳,获得10
11秒前
勤奋未来发布了新的文献求助10
11秒前
今后应助lzc采纳,获得10
11秒前
12秒前
随缘完成签到,获得积分10
12秒前
淡定小凝发布了新的文献求助10
12秒前
12秒前
12秒前
14秒前
14秒前
14秒前
高分求助中
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
Ribozymes and aptamers in the RNA world, and in synthetic biology 500
Evolution 3rd edition 500
Die Gottesanbeterin: Mantis religiosa: 656 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3177852
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2828840
关于积分的说明 7968661
捐赠科研通 2490059
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1327390
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 635231
版权声明 602888