亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整的填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

Reduction of the resistome risk from cow slurry and manure microbiomes to soil and vegetable microbiomes

抵抗性 肥料 生物 微生物群 土壤微生物学 生物技术 泥浆 基因组 兽医学 农学 抗生素耐药性 抗生素 土壤水分 微生物学 生态学 环境科学 环境工程 整合子 生物信息学 遗传学 基因 医学
作者
Leire Jauregi,Lur Epelde,Aitor González,José Luis Lavín,Carlos Garbisu
出处
期刊:Environmental Microbiology [Wiley]
卷期号:23 (12): 7643-7660 被引量:6
标识
DOI:10.1111/1462-2920.15842
摘要

In cow farms, the interaction between animal and environmental microbiomes creates hotspots for antibiotic resistance dissemination. A shotgun metagenomic approach was used to survey the resistome risk in five dairy cow farms. To this purpose, 10 environmental compartments were sampled: 3 of them linked to productive cows (fresh slurry, stored slurry, slurry-amended pasture soil); 6 of them to non-productive heifers and dry cows (faeces, fresh manure, aged manure, aged manure-amended orchard soil, vegetables-lettuces and grazed soil); and, finally, unamended control soil. The resistome risk was assessed using MetaCompare, a computational pipeline which scores the resistome risk according to possible links between antibiotic resistance genes (ARGs), mobile genetic elements (MGEs) and human pathogens. The resistome risk decreased from slurry and manure microbiomes to soil and vegetable microbiomes. In total (sum of all the compartments), 18,157 ARGs were detected: 24% related to ansamycins, 21% to multidrugs, 14% to aminoglycosides, 12% to tetracyclines, 9% to β-lactams, and 9% to macrolide-lincosamide-streptogramin B. All but two of the MGE-associated ARGs were only found in the animal dejections (not in soil or vegetable samples). Several ARGs with potential as resistome risk markers (based on their presence in hubs of co-occurrence networks and high dissemination potential) were identified. As a precautionary principle, improved management of livestock dejections is necessary to minimize the risk of antibiotic resistance.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
JamesPei应助科研通管家采纳,获得10
35秒前
郗妫完成签到,获得积分10
37秒前
1分钟前
郜南烟发布了新的文献求助10
1分钟前
Venus完成签到 ,获得积分10
3分钟前
在水一方应助chenyuns采纳,获得30
3分钟前
JACk完成签到 ,获得积分10
3分钟前
3分钟前
chenyuns发布了新的文献求助30
3分钟前
爱静静应助李伟采纳,获得10
3分钟前
4分钟前
zhangyimg发布了新的文献求助10
4分钟前
4分钟前
郜南烟发布了新的文献求助10
5分钟前
斯文败类应助郜南烟采纳,获得10
5分钟前
思源应助chenyuns采纳,获得20
5分钟前
Akim应助chenyuns采纳,获得20
5分钟前
领导范儿应助圆圆的波仔采纳,获得10
6分钟前
6分钟前
6分钟前
李爱国应助怕孤单的灵寒采纳,获得10
6分钟前
圆圆的波仔完成签到,获得积分10
7分钟前
7分钟前
7分钟前
怕孤单的灵寒完成签到,获得积分20
7分钟前
7分钟前
chenyuns发布了新的文献求助20
7分钟前
7分钟前
CZLhaust发布了新的文献求助10
7分钟前
7分钟前
Sherling发布了新的文献求助10
7分钟前
李爱国应助Sherling采纳,获得10
8分钟前
CZLhaust完成签到,获得积分10
8分钟前
8分钟前
jingjili发布了新的文献求助30
8分钟前
酷波er应助科研通管家采纳,获得10
8分钟前
8分钟前
郜南烟发布了新的文献求助10
8分钟前
8分钟前
chenyuns发布了新的文献求助20
8分钟前
高分求助中
Evolution 10000
Sustainability in Tides Chemistry 2800
The Young builders of New china : the visit of the delegation of the WFDY to the Chinese People's Republic 1000
юрские динозавры восточного забайкалья 800
English Wealden Fossils 700
叶剑英与华南分局档案史料 500
Foreign Policy of the French Second Empire: A Bibliography 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3146771
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2798063
关于积分的说明 7826621
捐赠科研通 2454573
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1306394
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 627708
版权声明 601527