The atomic simulation environment—a Python library for working with atoms

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作者
Ask Hjorth Larsen,Jens Jørgen Mortensen,Jakob Blomqvist,Ivano E. Castelli,Rune Christensen,Marcin Dułak,Jesper Friis,Michael N. Groves,Bjørk Hammer,Cory Hargus,Eric Hermes,Paul C. Jennings,P. Jensen,James R. Kermode,John R. Kitchin,Esben L. Kolsbjerg,Joseph Kubal,Kristen Kaasbjerg,Steen Lysgaard,Jón Bergmann Maronsson,Tristan Maxson,Thomas Olsen,Lars Pastewka,Andrew A. Peterson,C. Rostgaard,Jakob Schiøtz,Ole Schütt,Mikkel Strange,Kristian S. Thygesen,Tejs Vegge,Lasse B. Vilhelmsen,Michael Walter,Zhenhua Zeng,Karsten W. Jacobsen
出处
期刊:Journal of Physics: Condensed Matter [IOP Publishing]
卷期号:29 (27): 273002-273002 被引量:3361
标识
DOI:10.1088/1361-648x/aa680e
摘要

The atomic simulation environment (ASE) is a software package written in the Python programming language with the aim of setting up, steering, and analyzing atomistic simulations. In ASE, tasks are fully scripted in Python. The powerful syntax of Python combined with the NumPy array library make it possible to perform very complex simulation tasks. For example, a sequence of calculations may be performed with the use of a simple 'for-loop' construction. Calculations of energy, forces, stresses and other quantities are performed through interfaces to many external electronic structure codes or force fields using a uniform interface. On top of this calculator interface, ASE provides modules for performing many standard simulation tasks such as structure optimization, molecular dynamics, handling of constraints and performing nudged elastic band calculations.
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