MINDG: a drug–target interaction prediction method based on an integrated learning algorithm

计算机科学 图形 人工智能 机器学习 补语(音乐) 卷积神经网络 序列(生物学) 药物靶点 深度学习 人工神经网络 理论计算机科学 基因 药理学 生物 表型 医学 生物化学 化学 互补 遗传学
作者
Hai-Long Yang,Yue Chen,Yun Zuo,Zhaohong Deng,Xiaoyong Pan,Hong‐Bin Shen,Kup‐Sze Choi,Dong‐Jun Yu
出处
期刊:Bioinformatics [Oxford University Press]
卷期号:40 (4) 被引量:1
标识
DOI:10.1093/bioinformatics/btae147
摘要

Drug-target interaction (DTI) prediction refers to the prediction of whether a given drug molecule will bind to a specific target and thus exert a targeted therapeutic effect. Although intelligent computational approaches for drug target prediction have received much attention and made many advances, they are still a challenging task that requires further research. The main challenges are manifested as follows: (i) most graph neural network-based methods only consider the information of the first-order neighboring nodes (drug and target) in the graph, without learning deeper and richer structural features from the higher-order neighboring nodes. (ii) Existing methods do not consider both the sequence and structural features of drugs and targets, and each method is independent of each other, and cannot combine the advantages of sequence and structural features to improve the interactive learning effect.

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