Novosphingobium mangrovi sp. nov., isolated from mangrove sediment

生物 16S核糖体RNA 系统发育树 拉伤 微生物学 黄杆菌科 拟杆菌 细菌 基因 生物化学 遗传学 解剖
作者
Qian Huang,Zhihui Qian,Tao Peng,Jin Li,Xueying Ye,Tongwang Huang,Zhong Hu
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:73 (5) 被引量:1
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.005896
摘要

A novel Gram-stain-negative, aerobic and rod-shaped bacterial strain, designated as HK4-1T, was isolated from mangrove sediments in Hong Kong, PR China. Based on 16S rRNA gene sequence data, strain HK4-1T was found to belong to the genus Novosphingobium, family Erythrobacteraceae, and showed high similarity to Novosphingobium chloroacetimidivorans BUT-14T (96.88 %) and Novosphingobium indicum H25T (96.88 %). The G+C content of the whole genome of strain HK4-1T was 64.05 mol%. The major fatty acids were C16 : 0, C18 : 1 ω7c and summed feature 3 (C16 : 1 ω7c and/or C16 : 1 ω6c). The major polar lipids were phosphatidylethanolamine, phosphatidylglycerol, phosphatidylcholine, sphingoglycolipid and two unknown lipids. The predominant respiratory quinone was Q-10. Based on genomic, phylogenetic, phenotypic, physiological and chemotaxonomic data, strain HK4-1T should be classified as representing a novel species of the genus Novosphingobium, for which the name Novosphingobium mangrovi sp. nov. is proposed. The type strain of Novosphingobium mangrovi sp. nov. is HK4-1T (=MCCC 1K08252T=JCM 35764T).
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