Detection of MicroRNA-155 based on lambda exonuclease selective digestion and CRISPR/cas12a-assisted amplification

清脆的 核酸外切酶 小RNA 计算生物学 核酸外切酶 III 分子生物学 化学 生物 遗传学 DNA 基因 聚合酶 大肠杆菌
作者
Haotian Zhang,Jun Xu,Shiwen Liu,Hongbo Li,Lianlian Xu,Suqin Wang
出处
期刊:Analytical Biochemistry [Elsevier]
卷期号:693: 115592-115592
标识
DOI:10.1016/j.ab.2024.115592
摘要

In numerous malignancies, miRNA-155 is overexpressed and has oncogenic activity because it is one of the most efficient microRNAs for inhibiting apoptosis in human cancer cells. As a result, the highest sensitive detection of the miRNA-155 gene is a technological instrument that can enable early cancer screening. In this study, a miRNA-155 biosensor was created to create a hairpin probe that can bind to the miRNA-155 gene using lambda nucleic acid exonuclease, which can cut the 5' phosphorylated double strand, and by the DNA probe is recognized by the Cas12a enzyme, which then activates Cas12a to catalyze trans-cutting produces strong fluorescence. Research finding, the target concentration's logarithm and corresponding fluorescence intensity have a strong linear connection, and the limit of detection (LOD) of the sensing system was determined to be 8.3 pM. In addition, the biosensor displayed exceptional specificity, low false-positive signal, and high sensitivity in detecting the miRNA-155 gene in serum samples. This study's creation of a biosensor that has high sensitivity, good selectivity, and is simple to operate provides promising opportunities for research into biosensor design and early cancer detection.
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