Splicing factors: Insights into their regulatory network in alternative splicing in cancer

选择性拼接 RNA剪接 剪接体 生物 基因 基因亚型 计算生物学 前体mRNA 细胞生物学 遗传学 核糖核酸
作者
Jun-Xian Du,Gui‐Qi Zhu,Jia-Liang Cai,Biao Wang,Yihong Luo,Cong Chen,Cheng-Zhe Cai,Sijia Zhang,Jian Zhou,Jia Fan,Wei Zhu,Zhi Dai
出处
期刊:Cancer Letters [Elsevier BV]
卷期号:501: 83-104 被引量:36
标识
DOI:10.1016/j.canlet.2020.11.043
摘要

More than 95% of all human genes are alternatively spliced after transcription, which enriches the diversity of proteins and regulates transcript and/or protein levels. The splicing isoforms produced from the same gene can manifest distinctly, even exerting opposite effects. Mounting evidence indicates that the alternative splicing (AS) mechanism is ubiquitous in various cancers and drives the generation and maintenance of various hallmarks of cancer, such as enhanced proliferation, inhibited apoptosis, invasion and metastasis, and angiogenesis. Splicing factors (SFs) play pivotal roles in the recognition of splice sites and the assembly of spliceosomes during AS. In this review, we mainly discuss the similarities and differences of SF domains, the details of SF function in AS, the effect of SF-driven pathological AS on different hallmarks of cancer, and the main drivers of SF expression level and subcellular localization. In addition, we briefly introduce the application prospects of targeted therapeutic strategies, including small-molecule inhibitors, siRNAs and splice-switching oligonucleotides (SSOs), from three perspectives (drivers, SFs and pathological AS). Finally, we share our insights into the potential direction of research on SF-centric AS-related regulatory networks.
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