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Neuronal subtypes and diversity revealed by single-nucleus RNA sequencing of the human brain

细胞结构 人脑 生物 转录组 基因 计算生物学 神经科学 基因表达 核糖核酸 遗传学
作者
Blue B. Lake,Rizi Ai,Gwendolyn E. Kaeser,Neeraj Salathia,Yun C. Yung,Rui Liu,André Wildberg,Derek Gao,Ho-Lim Fung,Song Chen,Raakhee Vijayaraghavan,Julian Wong,Allison Chen,Xiaoyan Sheng,Fiona Kaper,Richard Shen,Mostafa Ronaghi,Jian‐Bing Fan,Wei Wang,Jerold Chun,Kun Zhang
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science (AAAS)]
卷期号:352 (6293): 1586-1590 被引量:886
标识
DOI:10.1126/science.aaf1204
摘要

Single-nucleus gene expression Identifying the genes expressed at the level of a single cell nucleus can better help us understand the human brain. Blue et al. developed a single-nuclei sequencing technique, which they applied to cells in classically defined Brodmann areas from a postmortem brain. Clustering of gene expression showed concordance with the area of origin and defining 16 neuronal subtypes. Both excitatory and inhibitory neuronal subtypes show regional variations that define distinct cortical areas and exhibit how gene expression clusters may distinguish between distinct cortical areas. This method opens the door to widespread sampling of the genes expressed in a diseased brain and other tissues of interest. Science , this issue p. 1586
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