Mycobacterium abscessus: insights from a bioinformatic perspective

脓肿分枝杆菌 非结核分枝杆菌 抗生素耐药性 微生物群 疾病 抗生素 抵抗性 生物 病菌 医学 蛋白质组 免疫学 生物信息学 微生物学 分枝杆菌 肺结核 病理 整合子
作者
Saubashya Sur,Tanushree Patra,Mistu Karmakar,Anindita Banerjee
出处
期刊:Critical Reviews in Microbiology [Informa]
卷期号:49 (4): 499-514 被引量:2
标识
DOI:10.1080/1040841x.2022.2082268
摘要

Mycobacterium abscessus is a nontuberculous mycobacterium, associated with broncho-pulmonary infections in individuals suffering from cystic fibrosis, bronchiectasis, and pulmonary diseases. The risk factors for transmission include biofilms, contaminated water resources, fomites, and infected individuals. M. abscessus is extensively resistant to antibiotics. To date, there is no vaccine and combination antibiotic therapy is followed. However, drug toxicities, low cure rates, and high cost of treatment make it imperfect. Over the last 20 years, bioinformatic studies on M. abscessus have advanced our understanding of the pathogen. This review integrates knowledge from the analysis of genomes, microbiomes, genomic variations, phylogeny, proteome, transcriptome, secretome, antibiotic resistance, and vaccine design to further our understanding. The utility of genome-based studies in comprehending disease progression, surveillance, tracing transmission routes, and epidemiological outbreaks on a global scale has been highlighted. Furthermore, this review underlined the importance of using computational methodologies for pinpointing factors responsible for pathogen survival and resistance. We reiterate the significance of interdisciplinary research to fight M. abscessus. In a nutshell, the outcome of computational studies can go a long way in creating novel therapeutic avenues to control M. abscessus mediated pulmonary infections.
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