A guided tour into subcellular colocalization analysis in light microscopy

共域化 分区(防火) 计算机科学 生物 计算生物学 工具箱 细胞生物学 显微镜 病理 医学 生物化学 程序设计语言
作者
Susanne Bolte,Fabrice P. Cordelières
出处
期刊:Journal of Microscopy [Wiley]
卷期号:224 (3): 213-232 被引量:4387
标识
DOI:10.1111/j.1365-2818.2006.01706.x
摘要

Summary It is generally accepted that the functional compartmentalization of eukaryotic cells is reflected by the differential occurrence of proteins in their compartments. The location and physiological function of a protein are closely related; local information of a protein is thus crucial to understanding its role in biological processes. The visualization of proteins residing on intracellular structures by fluorescence microscopy has become a routine approach in cell biology and is increasingly used to assess their colocalization with well‐characterized markers. However, image‐analysis methods for colocalization studies are a field of contention and enigma. We have therefore undertaken to review the most currently used colocalization analysis methods, introducing the basic optical concepts important for image acquisition and subsequent analysis. We provide a summary of practical tips for image acquisition and treatment that should precede proper colocalization analysis. Furthermore, we discuss the application and feasibility of colocalization tools for various biological colocalization situations and discuss their respective strengths and weaknesses. We have created a novel toolbox for subcellular colocalization analysis under ImageJ, named JACoP, that integrates current global statistic methods and a novel object‐based approach.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
臧真完成签到 ,获得积分10
刚刚
包子妹妹发布了新的文献求助10
1秒前
2秒前
3秒前
丹青发布了新的文献求助10
3秒前
顾矜应助xx采纳,获得10
3秒前
俭朴的世立完成签到,获得积分10
3秒前
3秒前
4秒前
asd发布了新的文献求助20
5秒前
6秒前
8秒前
冷艳方盒发布了新的文献求助10
8秒前
什么东西完成签到,获得积分10
8秒前
千秋发布了新的文献求助20
8秒前
yier发布了新的文献求助10
8秒前
思源应助Peng采纳,获得10
9秒前
9秒前
9秒前
小二郎应助CSC采纳,获得10
10秒前
酷酷碧发布了新的文献求助10
10秒前
11秒前
任1220发布了新的文献求助10
12秒前
VVV关注了科研通微信公众号
14秒前
月夙发布了新的文献求助10
14秒前
Hear完成签到,获得积分10
14秒前
luvebiubiu完成签到,获得积分20
14秒前
包子妹妹发布了新的文献求助10
14秒前
小钧发布了新的文献求助10
15秒前
yu发布了新的文献求助10
15秒前
传奇3应助乐观小之采纳,获得10
17秒前
luvebiubiu发布了新的文献求助10
17秒前
成就惜蕊完成签到,获得积分20
17秒前
共享精神应助。。。采纳,获得10
18秒前
18秒前
huang完成签到,获得积分10
18秒前
19秒前
20秒前
Olivia完成签到,获得积分10
21秒前
asd发布了新的文献求助10
21秒前
高分求助中
좌파는 어떻게 좌파가 됐나:한국 급진노동운동의 형성과 궤적 2500
Sustainability in Tides Chemistry 1500
TM 5-855-1(Fundamentals of protective design for conventional weapons) 1000
Cognitive linguistics critical concepts in linguistics 800
Threaded Harmony: A Sustainable Approach to Fashion 799
Livre et militantisme : La Cité éditeur 1958-1967 500
氟盐冷却高温堆非能动余热排出性能及安全分析研究 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3051673
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2708949
关于积分的说明 7415188
捐赠科研通 2353340
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1245507
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 605743
版权声明 595855