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Exploring Plausible Therapeutic Targets for Alzheimer's Disease using Multi-omics Approach, Machine Learning and Docking

疾病 转录组 计算生物学 药物发现 表观遗传学 组学 生物 蛋白质组 生物信息学 基因组学 基因 医学 基因组 基因表达 遗传学 病理
作者
M. Michael Gromiha,S. Akila Parvathy Dharshini,Nela Pragathi Sneha,Dhanusha Yesudhas,A. Kulandaisamy,Uday Rangaswamy,S. Anusuya,Y-h. Taguchi
出处
期刊:Current Topics in Medicinal Chemistry [Bentham Science]
卷期号:22 (22): 1868-1879 被引量:4
标识
DOI:10.2174/1568026622666220902110115
摘要

Abstract: The progressive deterioration of neurons leads to Alzheimer's disease (AD), and develop-ing a drug for this disorder is challenging. Substantial gene/transcriptome variability from multiple cell types leads to downstream pathophysiologic consequences that represent the heterogeneity of this disease. Identifying potential biomarkers for promising therapeutics is strenuous due to the fact that the transcriptome, epigenetic, or proteome changes detected in patients are not clear whether they are the cause or consequence of the disease, which eventually makes the drug discovery efforts intricate. The advancement in scRNA-sequencing technologies helps to identify cell type-specific biomarkers that may guide the selection of the pathways and related targets specific to different stages of the disease progression. This review is focussed on the analysis of multi-omics data from various perspectives (genomic and transcriptomic variants, and single-cell expression), which pro-vide insights to identify plausible molecular targets to combat this complex disease. Further, we briefly outlined the developments in machine learning techniques to prioritize the risk-associated genes, predict probable mutations and identify promising drug candidates from natural products.
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