Antribacter soli sp. nov., a novel actinobacterium isolated from soils of weathering dolomite

生物 16S核糖体RNA 二氨基酸 拉伤 肽聚糖 系统发育树 基因组DNA 微生物学 植物 基因 生物化学 基因序列 解剖
作者
Ya Ping Zhang,Yuan Gao,Jiaxin Yao,Lingxiao Liu,Zhi-Yao Ma,Cheng Liang Cao,Rongpeng Li,Ji-Hong Jiang,Jinjuan Liu
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:73 (5)
标识
DOI:10.1099/ijsem.0.005771
摘要

Strain KLBMP 9083 T , a novel actinobacterium, was isolated from weathered soils collected from a karst area in Anshun, Guizhou Province, PR China. The taxonomic position of strain KLBMP 9083 T was studied using the polyphasic approach. Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence indicated that strain KLBMP 9083 T formed a stabilized monophyletic clade with its closest relative strain Antribacter gilvus CGMCC 1.13856 T (98.4 % 16S rRNA gene sequence similarity). The peptidoglycan hydrolysates contained alanine, glutamic acid, threonine and lysine. The polar lipids were composed of diphosphatidylglycerol, phosphatidylinositol, phosphatidylinositol mannoside, an unidentified phosphoglycolipid, an unidentified phospholipid and an unidentified glycolipid. The predominant menaquinones were MK-9(H 8 ) (87.1 %), MK-9(H 6 ) (7.3 %) and MK-9(H 4 ) (5.6 %). The major fatty acids (>10 %) were anteiso-C 15 : 0 and iso-C 15 : 0 . The genomic DNA G+C content was 72.3 mol%. The digital DNA–DNA hybridization and average nucleotide identity values between strain KLBMP 9083 T and A. gilvus CGMCC 1.13856 T were 23.4 and 79.9 %, respectively. On the basis of morphological, chemotaxonomic and phylogenetic characteristics, strain KLBMP 9083 T represents a novel species of the genus Antribacter , for which the name Antribacter soli sp. nov. is proposed. The type strain is KLBMP 9083 T (=CGMCC 4.7737 T =NBRC 115577 T ).
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