For: Biochem. Biophys. Res. Commun. A three-step “ping-pong” mechanism of a GH20 β-N-acetylglucosaminidase from Vibrio campbellii belonging to a major Clade A-I of the phylogenetic tree of the enzyme superfamily

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作者
Yong Zhou,Waraporn Rernglit,Tamo Fukamizo,Jeerus Sucharitakul,Wipa Suginta
出处
期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications [Elsevier]
卷期号:729: 150357-150357
标识
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150357
摘要

β-N-acetylglucosaminidase (GlcNAcase) is an essential biocatalyst in chitin assimilation by marine Vibrio species, which rely on chitin as their main carbon source. Structure-based phylogenetic analysis of the GlcNAcase superfamily revealed that a GlcNAcase from Vibrio campbellii, formerly named V. harveyi, (VhGlcNAcase) belongs to a major clade, Clade A-I, of the phylogenetic tree. Pre-steady-state and steady-state kinetic analysis of the reaction catalysed by VhGlcNAcase with the fluorogenic substrate 4-methylumbelliferyl N-acetyl-β-D-glucosaminide suggested the following mechanism: (1) the Michaelis-Menten complex is formed in a rapid enzyme-substrate equilibrium with a K
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