Eukaryotic Translational Coupling in UAAUG Stop-Start Codons for the Bicistronic RNA Translation of the Non-Long Terminal Repeat Retrotransposon SART1

后转座子 生物 起始密码子 遗传学 长终端重复 平移移码 打开阅读框 核糖核酸 终止密码子 翻译(生物学) 真核翻译 信使核糖核酸 基因 转座因子 基因表达 肽序列 基因组
作者
Kenji K. Kojima,Takumi Matsumoto,Haruhiko Fujiwara
出处
期刊:Molecular and Cellular Biology [American Society for Microbiology]
卷期号:25 (17): 7675-7686 被引量:37
标识
DOI:10.1128/mcb.25.17.7675-7686.2005
摘要

Most eukaryotic cellular mRNAs are monocistronic; however, many retroviruses and long terminal repeat (LTR) retrotransposons encode multiple proteins on a single RNA transcript using ribosomal frameshifting. Non-long terminal repeat (non-LTR) retrotransposons are considered the ancestor of LTR retrotransposons and retroviruses, but their translational mechanism of bicistronic RNA remains unknown. We used a baculovirus expression system to produce a large amount of the bicistronic RNA of SART1, a non-LTR retrotransposon of the silkworm, and were able to detect the second open reading frame protein (ORF2) by Western blotting. The ORF2 protein was translated as an independent protein, not as an ORF1-ORF2 fusion protein. We revealed by mutagenesis that the UAAUG overlapping stop-start codon and the downstream RNA secondary structure are necessary for efficient ORF2 translation. Increasing the distance between the ORF1 stop codon and the ORF2 start codon decreased translation efficiency. These results are different from the eukaryotic translation reinitiation mechanism represented by the yeast GCN4 gene, in which the probability of reinitiation increases as the distance between the two ORFs increases. The translational mechanism of SART1 ORF2 is analogous to translational coupling observed in prokaryotes and viruses. Our results indicate that translational coupling is a general mechanism for bicistronic RNA translation.

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