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Data on DNA-seq analysis of Endophytic Streptomyces sp. SUK 48

康蒂格 基因组 生物 基因簇 遗传学 基因 全基因组测序 DNA测序 链霉菌 聚酮 计算生物学 细菌 生物合成
作者
Siti Junaidah Ahmad,Noraziah Mohamad Zin
出处
期刊:Data in Brief [Elsevier]
卷期号:35: 106768-106768 被引量:1
标识
DOI:10.1016/j.dib.2021.106768
摘要

The data genome sequence of SUK 48 consists of 8,341,706 bp, comprising of one contig with a high G + C content of 72.33%. The genome sequence encodes for 67 tRNAs and 21 rRNAs in one contig. SUK48 was found to have low similarities with other Streptomyces sp. (81–93% ANI indices) indicating that the isolated strain has a unique genome property and is presumably a novel species. This genome includes 34 genetic clusters responsible for the synthesis of secondary metabolites, including two polyketide synthase (PKS) clusters; one PKS type II cluster gene, one PKS gene cluster type III, five NRPS genetic clusters, and five PKS/NRPS hybrid clusters.
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