Gene Structure, cDNA Cloning, and Expression of a Mouse Mercurial-Insensitive Water Channel

生物 分子生物学 互补DNA 基因组DNA 内含子 外显子 南方斑点 基因 基因亚型 cDNA文库 基因组文库 选择性拼接 北方斑点 底漆延伸 分子克隆 cDNA末端的快速扩增 遗传学 肽序列 信使核糖核酸
作者
Tonghui Ma,Baoxue Yang,A.S. Verkman
出处
期刊:Genomics [Elsevier]
卷期号:33 (3): 382-388 被引量:37
标识
DOI:10.1006/geno.1996.0214
摘要

Three cDNAs encoding isoforms of a mercurial-insensitive water channel (mMIWC) were cloned from a mouse brain cDNA library. The predicted proteins had distinct N-terminal sequences and were 32.0 (mMIWC1), 34.3 (mMIWC2), and 37.8 (mMIWC3) kDa. Immunoblot analysis of mouse brain membranes with a C-terminus-derived polyclonal antibody was consistent with the predicted sizes. Expression in Xenopus oocytes indicated that each isoform functioned as a mercurial-insensitive, water-selective channel. Northern blot analysis indicated a major transcript of 5.5 kb in brain > eye > lung approximately kidney, and a minor 1.7-kb transcript in heart and muscle. Sequence comparison of mMIWC1 cDNA with a cloned 24-kb mouse genomic DNA indicated three introns (lengths 1.5, 0.5, and 4.0 kb) separating four exons with boundaries at amino acids 127, 182, and 209; analysis of mMIWC2 and mMIWC3 sequences indicated an additional intron at nucleotide -34 upstream from the mMIWC1 translation initiation site. The mMIWC1 promoter was identified and contained TATA, CAAT, GATA, and AP-2 elements; primer extension revealed mMIWC transcription initiation at 621 bp upstream from the mMIWC1 translational initiation site. Genomic Southern blot analysis revealed a single-copy mMIWC gene. These data indicate the presence of multiple mMIWC isoforms with distinct N-termini encoded by mRNAs produced by distinct transcriptional units and alternative splicing. The genomic cloning of mMIWC represents the first step in the construction of a targeting vector for mMIWC gene knockout.
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