清晨好,您是今天最早来到科研通的研友!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您科研之路漫漫前行!

Genotype-first in a cohort of 95 fetuses with multiple congenital abnormalities: when exome sequencing reveals unexpected fetal phenotype-genotype correlations

生物 外显子组测序 基因型 表型 遗传学 外显子组 胎儿 孟德尔遗传 基因型-表型区分 产前诊断 基因 生物信息学 怀孕
作者
Mathilde Lefebvre,Ange‐Line Bruel,Émilie Tisserant,Nicolas Bourgon,Yannis Duffourd,Sophie Collardeau‐Frachon,Tania Attié‐Bitach,Paul Kuentz,Mirna Assoum,Élise Schaefer,Salima El Chehadeh,Maria Cristina Antal,Valérie Kremer,Françoise Girard-Lemaitre,Jean‐Louis Mandel,Daphné Lehalle,Sophie Nambot,Nolwenn Jean‐Marçais,Nada Houcinat,Sébastien Moutton,Nathalie Marle,Laetita Lambert,Philippe Jonveaux,B. Foliguet,Jean-Pierre Mazutti,Dominique Gaillard,Elisabeth Alanio,Celine Poirisier,Anne-Sophie Lèbre,Marion Aubert-Lenoir,Francine Arbez‐Gindre,Sylvie Odent,Chloé Quēlin,Philippe Loget,Mélanie Fradin,Marjolaine Willems,Nicole Bigi,Marie-José Perez,Sophie Blesson,Christine Francannet,A. M. Beaufrére,Sophie Patrier-Sallebert,Anne‐Marie Guerrot,Alice Goldenberg,Anne-Claire Bréhin,James Lespinasse,Renaud Touraine,Yline Capri,Marie‐Hélène Saint‐Frison,Nicole Laurent,Christophe Philippe,Frédéric Tran Mau‐Them,Julien Thévenon,Laurence Faivre,Christel Thauvin‐Robinet,Antonio Vitobello
出处
期刊:Journal of Medical Genetics [BMJ]
卷期号:58 (6): 400-413 被引量:24
标识
DOI:10.1136/jmedgenet-2020-106867
摘要

Molecular diagnosis based on singleton exome sequencing (sES) is particularly challenging in fetuses with multiple congenital abnormalities (MCA). Indeed, some studies reveal a diagnostic yield of about 20%, far lower than in live birth individuals showing developmental abnormalities (30%), suggesting that standard analyses, based on the correlation between clinical hallmarks described in postnatal syndromic presentations and genotype, may underestimate the impact of the genetic variants identified in fetal analyses.We performed sES in 95 fetuses with MCA. Blind to phenotype, we applied a genotype-first approach consisting of combined analyses based on variants annotation and bioinformatics predictions followed by reverse phenotyping. Initially applied to OMIM-morbid genes, analyses were then extended to all genes. We complemented our approach by using reverse phenotyping, variant segregation analysis, bibliographic search and data sharing in order to establish the clinical significance of the prioritised variants.sES rapidly identified causal variant in 24/95 fetuses (25%), variants of unknown significance in OMIM genes in 8/95 fetuses (8%) and six novel candidate genes in 6/95 fetuses (6%).This method, based on a genotype-first approach followed by reverse phenotyping, shed light on unexpected fetal phenotype-genotype correlations, emphasising the relevance of prenatal studies to reveal extreme clinical presentations associated with well-known Mendelian disorders.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
ch发布了新的文献求助80
2秒前
优秀的dd完成签到 ,获得积分10
5秒前
6秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
10秒前
21秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
22秒前
imica完成签到 ,获得积分10
27秒前
wushuimei完成签到 ,获得积分10
44秒前
47秒前
如意2023完成签到 ,获得积分10
47秒前
孙老师完成签到 ,获得积分10
52秒前
Dmyb发布了新的文献求助10
54秒前
蝎子莱莱xth完成签到,获得积分10
1分钟前
Dmyb完成签到,获得积分10
1分钟前
氢锂钠钾铷铯钫完成签到,获得积分10
1分钟前
恒牙完成签到 ,获得积分10
1分钟前
Square完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
济民财完成签到,获得积分10
1分钟前
mzhang2完成签到 ,获得积分10
1分钟前
科研通AI2S应助雪山飞龙采纳,获得10
1分钟前
葫芦芦芦完成签到 ,获得积分10
1分钟前
zyjsunye完成签到 ,获得积分0
1分钟前
雪山飞龙完成签到,获得积分10
1分钟前
MUAN完成签到 ,获得积分10
1分钟前
wjx完成签到 ,获得积分10
2分钟前
量子星尘发布了新的文献求助10
2分钟前
沉静香氛完成签到 ,获得积分10
2分钟前
CipherSage应助zzy682采纳,获得10
2分钟前
2分钟前
周娅敏完成签到,获得积分10
2分钟前
filter完成签到,获得积分10
2分钟前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
2分钟前
harden9159完成签到,获得积分10
2分钟前
2分钟前
zzy682发布了新的文献求助10
2分钟前
2分钟前
周娅敏发布了新的文献求助10
2分钟前
小苹果完成签到,获得积分20
2分钟前
英姑应助周娅敏采纳,获得10
2分钟前
高分求助中
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 700
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
Nucleophilic substitution in azasydnone-modified dinitroanisoles 500
不知道标题是什么 500
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3976713
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3520805
关于积分的说明 11204819
捐赠科研通 3257584
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1798771
邀请新用户注册赠送积分活动 877897
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 806648