Hypoxia-associated alternative splicing signature in lung adenocarcinoma

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作者
Zhanyu Xu,Jiangbo Wei,Fanglu Qin,Yu Sun,Weiwei Xiang,Liqiang Yuan,Junqi Qin,Kun Deng,Tiaozhan Zheng,Shikang Li
出处
期刊:Epigenomics [Future Medicine]
卷期号:13 (1): 47-63 被引量:8
标识
DOI:10.2217/epi-2020-0399
摘要

Aim: To establish a signature based on hypoxia-related alternative splicing (AS) events for lung adenocarcinoma. Materials & methods: The least absolute shrinkage and selection operator Cox approach was used to construct a prognostic model. A nomogram that integrates the final AS predictor and stage was created. The network of the key AS events and splicing factors was created. Results: We created a prognostic signature of 11 AS events. Moreover, a nomogram that constitutes the pathological stage and risk was exhibited to be greatly effective in estimating the survival likelihood of lung adenocarcinoma patients. Conclusion: Herein we developed the first-ever signature based on hypoxia-related AS events with both prognostic predictive power and diagnostic efficacy.
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