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Hypoxia-associated alternative splicing signature in lung adenocarcinoma

列线图 生物 选择性拼接 腺癌 缺氧(环境) RNA剪接 肺癌 肿瘤科 比例危险模型 生物信息学 内科学 癌症 医学 基因 核糖核酸 信使核糖核酸 遗传学 氧气 化学 有机化学
作者
Zhanyu Xu,Jiangbo Wei,Fanglu Qin,Yu Sun,Weiwei Xiang,Liqiang Yuan,Junqi Qin,Kun Deng,Tiaozhan Zheng,Shikang Li
出处
期刊:Epigenomics [Future Medicine]
卷期号:13 (1): 47-63 被引量:8
标识
DOI:10.2217/epi-2020-0399
摘要

Aim: To establish a signature based on hypoxia-related alternative splicing (AS) events for lung adenocarcinoma. Materials & methods: The least absolute shrinkage and selection operator Cox approach was used to construct a prognostic model. A nomogram that integrates the final AS predictor and stage was created. The network of the key AS events and splicing factors was created. Results: We created a prognostic signature of 11 AS events. Moreover, a nomogram that constitutes the pathological stage and risk was exhibited to be greatly effective in estimating the survival likelihood of lung adenocarcinoma patients. Conclusion: Herein we developed the first-ever signature based on hypoxia-related AS events with both prognostic predictive power and diagnostic efficacy.
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