The multi-faceted nature of 15 CFTR exonic variations: Impact on their functional classification and perspectives for therapy

RNA剪接 错义突变 外显子跳跃 小基因 外显子 生物信息学 遗传学 选择性拼接 生物 基因 突变 计算生物学 医学 核糖核酸
作者
Anne Bergougnoux,Arnaud Billet,C. Ka,Matthew Heller,Fanny Degrugillier,Marie‐Laure Vuillaume,Vincent Thoreau,Souphatta Sasorith,Corinne Bareil,C. Thèze,Claude Férec,Gérald Le Gac,Thierry Bienvenu,Éric Bieth,Véronique Gaston,G. Lalau,A. Pagin,Marie‐Claire Malinge,Fabienne Dufernez,Lydie Lemonnier,M. Kœnig,Patricia Fergelot,Mireille Claustres,Magali Taulan,Alain Kitzis,M Reboul,Frédéric Becq,Pascale Fanen,C. Mekki,Marie‐Pierre Audrézet,E. Girodon,Caroline Raynal
出处
期刊:Journal of Cystic Fibrosis [Elsevier BV]
卷期号:22 (3): 515-524 被引量:1
标识
DOI:10.1016/j.jcf.2022.12.003
摘要

Background The majority of variants of unknown clinical significance (VUCS) in the CFTR gene are missense variants. While change on the CFTR protein structure or function is often suspected, impact on splicing may be neglected. Such undetected splicing default of variants may complicate the interpretation of genetic analyses and the use of an appropriate pharmacotherapy. Methods We selected 15 variants suspected to impact CFTR splicing after in silico predictions on 319 missense variants (214 VUCS), reported in the CFTR-France database. Six specialized laboratories assessed the impact of nucleotide substitutions on splicing (minigenes), mRNA expression levels (quantitative PCR), synthesis and maturation (western blot), cellular localization (immunofluorescence) and channel function (patch clamp) of the CFTR protein. We also studied maturation and function of the truncated protein, consecutive to in-frame aberrant splicing, on additional plasmid constructs. Results Six of the 15 variants had a major impact on CFTR splicing by in-frame (n = 3) or out-of-frame (n = 3) exon skipping. We reclassified variants into: splicing variants; variants causing a splicing defect and the impairment of CFTR folding and/or function related to the amino acid substitution; deleterious missense variants that impair CFTR folding and/or function; and variants with no consequence on the different processes tested. Conclusion The 15 variants have been reclassified by our comprehensive approach of in vitro experiments that should be used to properly interpret very rare exonic variants of the CFTR gene. Targeted therapies may thus be adapted to the molecular defects regarding the results of laboratory experiments.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
无限映波发布了新的文献求助10
刚刚
陈陈完成签到,获得积分10
1秒前
研究僧发布了新的文献求助10
2秒前
赘婿应助中原第一深情采纳,获得10
4秒前
xixi发布了新的文献求助30
5秒前
王者归来发布了新的文献求助200
5秒前
5秒前
6秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
7秒前
完美世界应助jing采纳,获得30
7秒前
李治稳发布了新的文献求助10
10秒前
12秒前
liu发布了新的文献求助10
13秒前
15秒前
严晓博完成签到,获得积分10
16秒前
16秒前
zhoup发布了新的文献求助20
17秒前
zzl-2000完成签到,获得积分10
17秒前
boshi发布了新的文献求助10
17秒前
xiaowei发布了新的文献求助10
18秒前
严晓博发布了新的文献求助10
18秒前
jing发布了新的文献求助30
19秒前
19秒前
Jzhu96发布了新的文献求助10
20秒前
20秒前
CC完成签到,获得积分10
21秒前
田様应助老迟到的沛萍采纳,获得10
21秒前
斯文静竹完成签到,获得积分10
21秒前
花海完成签到,获得积分10
22秒前
22秒前
wddddd发布了新的文献求助10
24秒前
ChatGPT发布了新的文献求助10
25秒前
开心尔芙发布了新的文献求助30
26秒前
FashionBoy应助zhangheng采纳,获得10
26秒前
liu完成签到,获得积分10
26秒前
27秒前
27秒前
强砸完成签到,获得积分10
28秒前
xu关闭了xu文献求助
28秒前
所所应助dyy采纳,获得10
29秒前
高分求助中
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 700
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
Nucleophilic substitution in azasydnone-modified dinitroanisoles 500
不知道标题是什么 500
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
Effective Learning and Mental Wellbeing 300
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3975339
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3519670
关于积分的说明 11199199
捐赠科研通 3256002
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1798043
邀请新用户注册赠送积分活动 877386
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 806305