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A Network Enhancement Method to Identify Spurious Drug-Drug Interactions

虚假关系 药品 计算机科学 药理学 医学 机器学习
作者
Huan Wang,Ziwen Cui,Yinguang Yang,B. Wang,Lida Zhu,Wen Zhang
出处
期刊:IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics [Institute of Electrical and Electronics Engineers]
卷期号:21 (5): 1335-1347 被引量:4
标识
DOI:10.1109/tcbb.2024.3385796
摘要

As medical safety and drug regulation gain heightened attention, the detection of spurious drug-drug interactions (DDI) has become key in healthcare. Although current research using graph neural networks (GNNs) to predict DDI has shown impressive results, it often fails to account for false DDI in the constructed DDI networks. Such inaccuracies caused by data errors, false alarms, or incorrect drug details can skew the network's structure and hinder the accuracy of GNN-based predictions. To tackle this challenge, we propose ANSM, a network-enhancement method specifically designed to identify and attenuate spurious links between drugs for ensuring the accuracy of DDI networks. ANSM integrates three key components: the feature extractor, the network optimizer, and the discriminative classifier. The feature extractor captures local structural features from drug node pairs, while the network optimizer leverages network information to improve feature extraction and reduce the impact of spurious DDI links. The discriminative classifier then identifies potential spurious links. Experimental results demonstrate that ANSM outperforms state-of-the-art methods in identifying spurious DDI.
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