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PySupercharge: a python algorithm for enabling ABC transporter bacterial secretion of all proteins through amino acid mutation

Python(编程语言) 分泌物 ATP结合盒运输机 运输机 氨基酸 计算生物学 生物 微生物学 计算机科学 生物化学 基因 程序设计语言
作者
Yerin Kim,D. Kim,Nguyen-Mihn Hieu,Hyunjong Byun,Jung Hoon Ahn
出处
期刊:Microbial Cell Factories [Springer Nature]
卷期号:23 (1)
标识
DOI:10.1186/s12934-024-02342-z
摘要

The process of producing proteins in bacterial systems and secreting them through ATP-binding cassette (ABC) transporters is an area that has been actively researched and used due to its high protein production capacity and efficiency. However, some proteins are unable to pass through the ABC transporter after synthesis, a phenomenon we previously determined to be caused by an excessive positive charge in certain regions of their amino acid sequence. If such an excessive charge is removed, the secretion of any protein through ABC transporters becomes possible.
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