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Mining coral-derived terpene synthases and mechanistic studies of the coral biflorane synthase

萜烯 ATP合酶 化学 环丙烷 立体化学 分子力学 脱质子化 计算化学 生物化学 分子动力学 有机化学 戒指(化学) 离子
作者
Bao Chen,Jingjing Mao,Kangwei Xu,Lijun Liu,Wei Lin,Yue‐Wei Guo,Ruibo Wu,Chengyuan Wang,Baofu Xu
出处
期刊:Science Advances [American Association for the Advancement of Science]
卷期号:11 (9)
标识
DOI:10.1126/sciadv.adv0805
摘要

Biflorane diterpenoids are unique natural products often seen in marine animals. Recent studies have reported a small number of biflorane synthases. However, the catalytic mechanism and structural basis for biflorane formation remain unclear. To address these issues, we conducted genome mining of terpene synthases from the sea whip coral Paramuricea clavata , resulting in the discovery of a biflorane synthase Pc TS1. We performed a series of isotope labeling, crystallography, quantum mechanics/molecular mechanics calculations, and mutagenesis studies toward Pc TS1 to investigate the mechanism. Isotopic labeling studies, together with calculations, elucidate a cascade of 1,10-cyclization, 1,3-hydride shift, 1,6-cyclization, 1,2-hydride shift, 2,6-cyclization, cyclopropane ring opening, and deprotonation by the generated pyrophosphate, forming the biflorane scaffold. Crystallography, quantum mechanics/molecular mechanics, and mutagenesis studies confirmed the cascade and produced different terpene scaffolds. Our work demonstrated the mechanism of marine biflorane formation, elucidated the second crystal structure of a coral terpene synthase, and realized the terpene skeleton expansion.
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