Machine learning-based integration develops an immune-derived lncRNA signature for improving outcomes in colorectal cancer

免疫系统 结直肠癌 医学 肿瘤科 临床意义 佐剂 计算机科学 生物信息学 免疫学 内科学 癌症 生物
作者
Zaoqu Liu,Long Liu,Siyuan Weng,Chunguang Guo,Qin Dang,Hui Xu,Libo Wang,Taoyuan Lu,Yuyuan Zhang,Zhenqiang Sun,Xinwei Han
出处
期刊:Nature Communications [Nature Portfolio]
卷期号:13 (1) 被引量:389
标识
DOI:10.1038/s41467-022-28421-6
摘要

Long noncoding RNAs (lncRNAs) are recently implicated in modifying immunology in colorectal cancer (CRC). Nevertheless, the clinical significance of immune-related lncRNAs remains largely unexplored. In this study, we develope a machine learning-based integrative procedure for constructing a consensus immune-related lncRNA signature (IRLS). IRLS is an independent risk factor for overall survival and displays stable and powerful performance, but only demonstrates limited predictive value for relapse-free survival. Additionally, IRLS possesses distinctly superior accuracy than traditional clinical variables, molecular features, and 109 published signatures. Besides, the high-risk group is sensitive to fluorouracil-based adjuvant chemotherapy, while the low-risk group benefits more from bevacizumab. Notably, the low-risk group displays abundant lymphocyte infiltration, high expression of CD8A and PD-L1, and a response to pembrolizumab. Taken together, IRLS could serve as a robust and promising tool to improve clinical outcomes for individual CRC patients.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
生动雪旋发布了新的文献求助10
刚刚
www完成签到,获得积分10
1秒前
笨笨的安彤关注了科研通微信公众号
1秒前
2秒前
佳足完成签到,获得积分10
2秒前
3秒前
3秒前
tongke完成签到,获得积分10
4秒前
Sarah发布了新的文献求助10
5秒前
上官若男应助1351567822采纳,获得20
5秒前
可爱的函函应助粉星星采纳,获得10
5秒前
5秒前
无花果应助乔一乔采纳,获得10
6秒前
7秒前
兜兜发布了新的文献求助30
7秒前
杨洁发布了新的文献求助10
8秒前
ycy发布了新的文献求助10
8秒前
mumu完成签到,获得积分20
8秒前
完美世界应助doby采纳,获得10
9秒前
10秒前
10秒前
10秒前
dddd发布了新的文献求助10
10秒前
10秒前
芋泥面包发布了新的文献求助10
10秒前
11秒前
12秒前
13秒前
zkyyinf_zero发布了新的文献求助10
13秒前
singfluer发布了新的文献求助10
14秒前
Sarah完成签到,获得积分10
14秒前
善学以致用应助apt采纳,获得10
14秒前
14秒前
15秒前
满意静丹发布了新的文献求助10
15秒前
欢呼山雁发布了新的文献求助10
15秒前
笑点低中心完成签到,获得积分10
15秒前
BEWATER发布了新的文献求助10
15秒前
15秒前
笔墨留香完成签到,获得积分10
16秒前
高分求助中
【此为提示信息,请勿应助】请按要求发布求助,避免被关 20000
All the Birds of the World 4000
Production Logging: Theoretical and Interpretive Elements 3000
Musculoskeletal Pain - Market Insight, Epidemiology And Market Forecast - 2034 2000
Animal Physiology 2000
Les Mantodea de Guyane Insecta, Polyneoptera 2000
Am Rande der Geschichte : mein Leben in China / Ruth Weiss 1500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 计算机科学 化学工程 内科学 复合材料 物理化学 电极 遗传学 量子力学 基因 冶金 催化作用
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3744491
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3287318
关于积分的说明 10053328
捐赠科研通 3003557
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1649127
邀请新用户注册赠送积分活动 785041
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 750915