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Current phylogeny of Rhodospirillaceae: A multi-approach study

生物 α蛋白细菌 红螺科 系统发育树 系统发育学 分类单元 系统类型 基因组 进化生物学 生态学 细菌 16S核糖体RNA 古生物学 遗传学 基因
作者
Mauro Degli Esposti,Luis Lozano,Esperanza Martínez‐Romero
出处
期刊:Molecular Phylogenetics and Evolution [Elsevier]
卷期号:139: 106546-106546 被引量:12
标识
DOI:10.1016/j.ympev.2019.106546
摘要

Rhodospirillaceae represents a major family of the class alphaproteobacteria that includes an increasing number of functionally diverse taxa. The aim of this work is to evaluate the present phylogenetic diversity of the Rhodospirillaceae, which includes several metagenome-assembled genomes of uncultivated bacteria, as well as cultivated bacteria that were previously classified in different families. Various methodological approaches have been followed to discern the phylogenetic diversity of the taxa associated with the Rhodospirillaceae, which are grouped in three major sub-divisions and several other taxonomic entities that are currently confined to the genus rank. These genera include Tistrella, Elstera, Dongia and Ferrovibrio among cultivated organisms and alphaproteobacteria bacterium 41-28 among uncultivated bacteria. Overall, this study adds at least 11 genera and over 40 species to the current set of taxa belonging to the Rhodospirillaceae, a taxonomic term that clearly requires amendment. We propose to re-classify all taxa associated with the Rhodospirillaceae family under the new order, Diaforabacterales ord. nov. (from the Greek word for diversity, διάφορα). This study also uncovers the likely root of Rhodospirillaceae among recently reported metagenome-assembled genomes of uncultivated marine and groundwater bacteria.
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