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Phage on tap–a quick and efficient protocol for the preparation of bacteriophage laboratory stocks

效价 噬菌体 溶解 微生物学 噬菌体疗法 生物 噬菌体 细菌病毒 化学 病毒学 分子生物学 病毒 大肠杆菌 生物化学 基因
作者
Natasha Bonilla,María Isabel Rojas,Giuliano Netto Flores Cruz,Shr-Hau Hung,Forest Rohwer,Jeremy J. Barr
出处
期刊:PeerJ [PeerJ]
卷期号:4: e2261-e2261 被引量:294
标识
DOI:10.7717/peerj.2261
摘要

A major limitation with traditional phage preparations is the variability in titer, salts, and bacterial contaminants between successive propagations. Here we introduce the Phage On Tap (PoT) protocol for the quick and efficient preparation of homogenous bacteriophage (phage) stocks. This method produces homogenous, laboratory-scale, high titer (up to 10 10–11 PFU·ml −1 ), endotoxin reduced phage banks that can be used to eliminate the variability between phage propagations and improve the molecular characterizations of phage. The method consists of five major parts, including phage propagation, phage clean up by 0.22 μm filtering and chloroform treatment, phage concentration by ultrafiltration, endotoxin removal, and the preparation and storage of phage banks for continuous laboratory use. From a starting liquid lysate of > 100 mL, the PoT protocol generated a clean, homogenous, laboratory phage bank with a phage recovery efficiency of 85% within just two days. In contrast, the traditional method took upwards of five days to produce a high titer, but lower volume phage stock with a recovery efficiency of only 4%. Phage banks can be further purified for the removal of bacterial endotoxins, reducing endotoxin concentrations by over 3,000-fold while maintaining phage titer. The PoT protocol focused on T-like phages, but is broadly applicable to a variety of phages that can be propagated to sufficient titer, producing homogenous, high titer phage banks that are applicable for molecular and cellular assays.
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