Noncanonical RNA‐capping: Discovery, mechanism, and physiological role debate

机制(生物学) 核糖核酸 生物 生物化学 化学 细胞生物学 计算生物学 认识论 基因 哲学
作者
Christina Julius,Yulia Yuzenkova
出处
期刊:Wiley Interdisciplinary Reviews - Rna [Wiley]
卷期号:10 (2) 被引量:27
标识
DOI:10.1002/wrna.1512
摘要

Recently a new type of 5′‐RNA cap was discovered. In contrast to the specialized eukaryotic m 7 G cap, the novel caps are abundant cellular cofactors like NAD + . RNAs capped with cofactors are found in prokaryotes and eukaryotes. Unlike m 7 G cap, installed by specialized enzymes, cofactors are attached by main enzyme of transcription, RNA polymerase (RNAP). Cofactors act as noncanonical initiating substrates, provided cofactor's nucleoside base‐pairs with template DNA at the transcription start site. Adenosine—containing NAD(H), flavin adenine dinucleotide (FAD), and CoA modify transcripts on promoters starting with +1A. Similarly, uridine‐containing cell wall precursors, for example, uridine diphosphate‐ N ‐acetylglucosamine were shown to cap RNA in vitro on +1U promoters. Noncanonical capping is a universal feature of evolutionary unrelated RNAPs—multisubunit bacterial and eukaryotic RNAPs, and single‐subunit mitochondrial RNAP. Cellular concentrations of cofactors, for example, NAD(H) are significantly higher than their K m in transcription. Yet, only a small proportion of a given cellular RNA is noncanonically capped (if at all). This proportion is a net balance between capping, seemingly stochastic, and decapping, possibly determined by RNA folding, protein binding and transcription rate. NUDIX hydrolases in bacteria and eukaryotes, and DXO family proteins eukaryotes act as decapping enzymes for noncanonical caps. The physiological role of noncanonical RNA capping is only starting to emerge. It was demonstrated to affect RNA stability in vivo in bacteria and eukaryotes and to stimulate RNAP promoter escape in vitro in Escherichia coli . NAD + /NADH capping ratio may connect transcription to cellular redox state. Potentially, noncanonical capping affects mRNA translation, RNA‐protein binding and RNA localization. This article is categorized under: RNA Processing > Capping and 5′ End Modifications RNA Export and Localization > RNA Localization RNA Structure and Dynamics > RNA Structure, Dynamics, and Chemistry
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
1秒前
陶醉的又夏完成签到 ,获得积分10
1秒前
lily完成签到 ,获得积分10
4秒前
5秒前
子苓完成签到 ,获得积分10
7秒前
Jun完成签到 ,获得积分10
7秒前
phil完成签到,获得积分10
8秒前
祁乐安发布了新的文献求助20
8秒前
如初完成签到,获得积分10
9秒前
zzuwxj完成签到,获得积分10
12秒前
糊涂的语兰完成签到,获得积分10
16秒前
多余完成签到,获得积分10
17秒前
喝酸奶不舔盖完成签到 ,获得积分10
17秒前
朴实初夏完成签到 ,获得积分10
18秒前
18秒前
华仔应助查查make采纳,获得10
23秒前
乐乐应助普鲁卡因采纳,获得10
23秒前
美海与鱼完成签到,获得积分10
23秒前
哦豁完成签到 ,获得积分10
24秒前
阿钱小钱完成签到 ,获得积分10
25秒前
世上僅有的榮光之路完成签到,获得积分0
25秒前
能干的蜗牛完成签到,获得积分10
26秒前
芽衣完成签到 ,获得积分10
29秒前
30秒前
英姑应助大橙子采纳,获得10
33秒前
普鲁卡因发布了新的文献求助10
35秒前
积极的帽子完成签到 ,获得积分10
35秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
37秒前
现代冷松完成签到,获得积分10
40秒前
Chimmy完成签到,获得积分10
45秒前
朴树朋友完成签到,获得积分20
45秒前
wlnhyF完成签到,获得积分10
47秒前
pursuit完成签到,获得积分10
50秒前
Neltharion完成签到,获得积分10
51秒前
沈海完成签到,获得积分10
53秒前
悦耳傥完成签到 ,获得积分10
53秒前
一叶知秋应助大橙子采纳,获得10
53秒前
科研小能手完成签到,获得积分10
54秒前
guoxingliu发布了新的文献求助200
55秒前
Double_N完成签到,获得积分10
58秒前
高分求助中
【提示信息,请勿应助】关于scihub 10000
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] 3000
徐淮辽南地区新元古代叠层石及生物地层 3000
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
Handbook of Industrial Diamonds.Vol2 1100
Global Eyelash Assessment scale (GEA) 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 550
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4038157
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3575869
关于积分的说明 11373842
捐赠科研通 3305650
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1819255
邀请新用户注册赠送积分活动 892655
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 815022