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Molecular characterization of novel endornavirus isolated from Ophiostoma bicolor associated with bark beetles

生物 真菌病毒 RNA解旋酶A 遗传学 RNA聚合酶 基因组 全基因组测序 核糖核酸 打开阅读框 病毒学 解旋酶 肽序列 基因
作者
Yuyao Zhu,Anna Lu,Zheng Wang,Quan Lu,Chengming Yu,Huixiang Liu
出处
期刊:Research Square - Research Square
标识
DOI:10.21203/rs.3.rs-1630236/v1
摘要

Abstract Ophiostoma bicolor is a pathogen fungus associated with bark beetles that can cause serious damage to host plants. In this study, a novel fungal virus “Ophiostoma bicolor endornavirus 1” (ObEV1) was obtained from O. bicolor , and its complete genome sequence was determined. ObEV1 has a singlestranded positive-sense (+ss) RNA genome of 10119 nucleotides, Sequence annotation and comparison showed that the viral genome has a single large open reading frame (ORF) encoding a polyprotein of 362.48 kDa. The polyprotein contains seven conserved domains: RNA dependent RNA polymerase (RdRp), Viral RNA Helicase 1 (VHel1), Viral-methyltransferase (VMet), DEAD-like helicases (DEXDc), gliding-GltJ (G1), large tegument protein UL36 (PHA) and YlqF-related-GTPase (Y). Sequence comparisons and phylogenetic analysis showed that ObEV1 is a novel mycovirus belonging to the Betaendornavirus of “ Endornaviridae ” family. This is the first report of mycovirus in O. bicolor of Ophiostomatoid fungi.

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